在 Centos 上安裝 R 'sf' 包 — gdal 共享庫錯誤

Question

如何在 CentOS 上安裝 R 'sf'軟件包？ 在嘗試安裝時，由於 gdal 軟件包過時，我最初遇到錯誤； 我更新了 gdal（從以下源代碼構建： http : //trac.osgeo.org/gdal/wiki/BuildingOnUnix ），現在有一個錯誤：

 checking GDAL: linking with --libs only... yes
 checking GDAL: /usr/local/share/gdal/pcs.csv readable... yes
 checking GDAL: checking whether PROJ.4 is available for linking:... yes
 checking GDAL: checking whether PROJ.4 is available fur running:... 
 ./gdal_proj: error while loading shared libraries: libgdal.so.20: cannot open 
 shared object file: No such file or directory
  no
 configure: error: OGRCoordinateTransformation() does not return a 
coord.trans: 
 PROJ.4 not available?
ERROR: configuration failed for package ‘sf’

我嘗試創建指向libgdal.so.20的符號鏈接，但這根本不會改變錯誤。

Answer 1

1. 將/usr/local/lib添加到例如/etc/ld.so.conf.d/libgdal-x86_64.conf
2. 運行 ldconfig
3. 重啟 R
4. 再試一次

Answer 2

@Dave 給出了確切的步驟 & 請按照以下步驟進行更多解釋。

1. 將/usr/local/lib添加到例如/etc/ld.so.conf.d/libgdal-x86_64.conf如果不存在請創建文件libgdal-x86_64.conf 。

#echo "/usr/local/lib" >> /etc/ld.so.conf.d/libgdal-x86_64.conf

2. 運行 ldconfig

#ldconfig

3. 確保您的系統上安裝了GEOS,GDAL,PROJ 。

#yum install proj.x86_64 proj-devel.x86_64 proj-epsg.x86_64 proj-nad.x86_64 geos*

再試一次

4. 轉到 R cli 並點擊install.packages("sf")

謝謝希望這有幫助

Answer 3

對於擁有多用戶/多計算機環境且需要安裝各種軟件的多個版本的其他任何人，我通過以下方式解決了我的問題：

install.packages('sf',configure.args='--with-gdal-config=/sw/gdal/2.2.3-gcc4/bin/gdal-config --with-proj-include=/sw/proj/4.9.3-gcc4/include --with-proj-lib=/sw/proj/4.9.3-gcc4/lib --with-proj-share=/sw/proj/4.9.3-gcc4/share/proj')

顯然，您可能/將不得不更改我所擁有的路徑名。