使用AWK從制表符分隔的文件中提取一列

Question

我知道這是一個簡單的問題，但是awk命令確實使我的大腦融化了。 我有一個制表符分隔的文件“ inputfile.gtf”，我需要從中提取一列並將其放入新文件“ newfile.tsv”中。我一生都無法找出用awk執行此操作的正確語法。 這是我嘗試過的：

awk -F, 'BEGIN{OFS="/t"} {print $8}'  inputfile.gtf  > newfile.tsv

也

awk 'BEGIN{OFS="/t";FS="/t"};{print $8}' inputfile.gtf  > newfile.tsv

這兩個都給我一個空文件。 在我到處搜尋的地方，人們似乎有完全不同的方式來嘗試完成此簡單任務，而此時我已完全迷失了方向。 任何幫助將不勝感激。 謝謝。

Answer 1

您指定了錯誤的定界符/t ， 制表符輸入\\t ：

awk 'BEGIN{ FS=OFS="\t" }{ print $8 }' inputfile.gtf  > newfile.tsv

Answer 2

為什么不簡單：

awk -F'\t' '{print $8}' inputfile.gtf  > newfile.tsv

Answer 3

您的第一個命令：

awk -F, 'BEGIN{OFS="/t"} {print $8}'  inputfile.gtf  > newfile.tsv

要設置-F,它不是必需的，因為你的文件不是,逗號分隔。

接下來， OFS="/t" ：語法不正確，應為OFS="\\t" ，但由於您不想將輸出字段分隔符設置為\\t ，因此您也不需要此，因為您正在打印在這種情況下，僅涉及一個記錄，OFS完全不涉及； 除非您至少打印兩個字段。

您的第二條命令：

awk 'BEGIN{OFS="/t";FS="/t"};{print $8}' inputfile.gtf  > newfile.tsv

同樣，它不是/t應該是\\t 。 FS="\\t"也類似於-F "\\t"

您實際需要的是：

awk -F"\t" '{print $8}' inputfile.gtf  > newfile.tsv

要么

awk -v FS="\t" '{print $8}' inputfile.gtf  > newfile.tsv

如果文件中只有tabs而字段之間沒有空格，則可以使用：

awk '{print $8}' inputfile.gtf  > newfile.tsv