使用AWK从制表符分隔的文件中提取一列

Question

我知道这是一个简单的问题，但是awk命令确实使我的大脑融化了。 我有一个制表符分隔的文件“ inputfile.gtf”，我需要从中提取一列并将其放入新文件“ newfile.tsv”中。我一生都无法找出用awk执行此操作的正确语法。 这是我尝试过的：

awk -F, 'BEGIN{OFS="/t"} {print $8}'  inputfile.gtf  > newfile.tsv

也

awk 'BEGIN{OFS="/t";FS="/t"};{print $8}' inputfile.gtf  > newfile.tsv

这两个都给我一个空文件。 在我到处搜寻的地方，人们似乎有完全不同的方式来尝试完成此简单任务，而此时我已完全迷失了方向。 任何帮助将不胜感激。 谢谢。

Answer 1

您指定了错误的定界符/t ， 制表符输入\\t ：

awk 'BEGIN{ FS=OFS="\t" }{ print $8 }' inputfile.gtf  > newfile.tsv

Answer 2

为什么不简单：

awk -F'\t' '{print $8}' inputfile.gtf  > newfile.tsv

Answer 3

您的第一个命令：

awk -F, 'BEGIN{OFS="/t"} {print $8}'  inputfile.gtf  > newfile.tsv

要设置-F,它不是必需的，因为你的文件不是,逗号分隔。

接下来， OFS="/t" ：语法不正确，应为OFS="\\t" ，但由于您不想将输出字段分隔符设置为\\t ，因此您也不需要此，因为您正在打印在这种情况下，仅涉及一个记录，OFS完全不涉及； 除非您至少打印两个字段。

您的第二条命令：

awk 'BEGIN{OFS="/t";FS="/t"};{print $8}' inputfile.gtf  > newfile.tsv

同样，它不是/t应该是\\t 。 FS="\\t"也类似于-F "\\t"

您实际需要的是：

awk -F"\t" '{print $8}' inputfile.gtf  > newfile.tsv

要么

awk -v FS="\t" '{print $8}' inputfile.gtf  > newfile.tsv

如果文件中只有tabs而字段之间没有空格，则可以使用：

awk '{print $8}' inputfile.gtf  > newfile.tsv