重擊：用另一列替換列並使用AWK打印特定順序

Question

我有一個虛擬文件，看起來像這樣：

a ID_1 S1 S2
b SNP1 1 0
c SNP2 2 1
d SNP3 1 0

我想用相應的行號替換第2列的內容。 我的文件將如下所示：

a 1 S1 S2
b 2 1 0
c 3 2 1
d 4 1 0

我可以使用以下命令執行此操作：

cut -f 1,3-4 -d " " file.txt | awk '{print $1 " " FNR " " $2,$3}'

我的問題是，有更好的方法嗎？ 特別是，我正在處理的實際文件有2303列。 顯然我不想寫：

cut -f 1,3-2303 -d " " file.txt | awk '{print $1 " " FNR " " $2,$3,$4,$5 ETC}'

有沒有一種方法可以告訴awk從第2列打印到最后一列，而不必寫下所有名稱？

謝謝

Answer 1

我認為這應該做

$ awk '{$2=FNR} 1' file.txt 
a 1 S1 S2
b 2 1 0
c 3 2 1
d 4 1 0

更改第二列並打印更改的記錄。 默認的OFS是單個空間，這是您在這里需要的

上面的命令是慣用的寫法

awk '{$2=FNR} {print $0}' file.txt 

您可以將簡單的awk程序視為awk 'cond1{action1} cond2{action2} ...'

僅當cond1評估為true時，才會執行action1 ，依此類推。 如果省略了action部分，則默認情況下， awk打印輸入記錄。 1只是寫入始終為真的條件的一種方法

有關更多此類習語，請參見https://stackoverflow.com/tags/awk/info中提到的慣用awk

Answer 2

跟隨awk也可以在這里幫助您。

awk '{sub(/.*/,FNR,$2)} 1'  Input_file

輸出如下。

a 1 S1 S2
b 2 1 0
c 3 2 1
d 4 1 0

說明：它的解釋很簡單，使用awk sub實用程序將$2 （第二個字段）中的所有內容替換$2 FNR ，這是awk的現成變量，代表任何Input_file的當前行號，然后提及1將打印當前行Input_file。