[英]Bash: replacing a column by another and using AWK to print specific order
我有一个虚拟文件,看起来像这样:
a ID_1 S1 S2
b SNP1 1 0
c SNP2 2 1
d SNP3 1 0
我想用相应的行号替换第2列的内容。 我的文件将如下所示:
a 1 S1 S2
b 2 1 0
c 3 2 1
d 4 1 0
我可以使用以下命令执行此操作:
cut -f 1,3-4 -d " " file.txt | awk '{print $1 " " FNR " " $2,$3}'
我的问题是,有更好的方法吗? 特别是,我正在处理的实际文件有2303列。 显然我不想写:
cut -f 1,3-2303 -d " " file.txt | awk '{print $1 " " FNR " " $2,$3,$4,$5 ETC}'
有没有一种方法可以告诉awk从第2列打印到最后一列,而不必写下所有名称?
谢谢
我认为这应该做
$ awk '{$2=FNR} 1' file.txt
a 1 S1 S2
b 2 1 0
c 3 2 1
d 4 1 0
更改第二列并打印更改的记录。 默认的OFS是单个空间,这是您在这里需要的
上面的命令是惯用的写法
awk '{$2=FNR} {print $0}' file.txt
您可以将简单的awk
程序视为awk 'cond1{action1} cond2{action2} ...'
仅当cond1
评估为true时,才会执行action1
,依此类推。 如果省略了action
部分,则默认情况下, awk
打印输入记录。 1
只是写入始终为真的条件的一种方法
有关更多此类习语,请参见https://stackoverflow.com/tags/awk/info中提到的惯用awk
跟随awk
也可以在这里帮助您。
awk '{sub(/.*/,FNR,$2)} 1' Input_file
输出如下。
a 1 S1 S2
b 2 1 0
c 3 2 1
d 4 1 0
说明:它的解释很简单,使用awk
sub
实用程序将$2
(第二个字段)中的所有内容替换$2
FNR
,这是awk
的现成变量,代表任何Input_file的当前行号,然后提及1
将打印当前行Input_file。
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