使用igraph讀取CSV數據

Question

我正在嘗試使用igraph讀取此數據，但不確定如何或從何處開始。

CSV中的每一行都有一個等級，按時間排序，格式如下：

SOURCE, TARGET, RATING, TIME

樣本數據：

6   2   4   1289241912
6   5   2   1289241942
1   15  1   1289243140

我嘗試了這個：

dat = read.csv('soc-sign-bitcoinotc.csv', header=FALSE)
mat = as.matrix(dat)
g = graph.adjacency(mat, mode = c('directed'), weighted = TRUE)

但我收到此錯誤：

Error in graph.adjacency.dense(adjmatrix, mode = mode, weighted = weighted,  : 
  not a square matrix

我假設我對數據結構使用了錯誤的方法

Answer 1

我想你想要graph.data.frame 。 dat的前兩列用於邊緣列表。 其余列假定為邊屬性。

g <- graph.data.frame(dat)

要獲得頂點，請使用V() ：

head(V(g))
+ 6/5881 vertices, named, from 6ace412:
[1] 6  1  4  13 7  2

要獲取邊緣，請使用E() ：

head(E(g))
+ 6/35592 edges from 6ace412 (vertex names):
[1] 6 ->2  6 ->5  1 ->15 4 ->3  13->16 13->10

屬性：

head(E(g)$rating)
[1] 4 2 1 7 8 8

head(E(g)$time)
[1] 1289241912 1289241942 1289243140 1289245277 1289254254 1289254301