[英]How to make contingency table over a list in r
主要的曝光量是aff
。 我想獲取aff
和varlist
所有變量的列聯表。 然后,我想使用這些列聯表進行卡方檢驗。 我的代碼如下:
name=names(data)
varlist=name[11:40]
models=lapply(varlist, function(x) {
chisq.test(table(substitute(data$i,list(i = as.name(x))),data$aff))
})
lapply(models, summary)
但是我有錯誤
Error in unique.default(x, nmax = nmax) :
unique() applies only to vectors
如何解決這個問題?
我認為您通過使用substitute
等使事情變得過於復雜。 沒有你的數據,我會盡力與mtcars
,利用cyl
作為暴露變量。
data <- mtcars
name <- names(data)
ev <- "cyl"
varlist <- name[ name != ev ]
models <- lapply(varlist, function(nm) {
chisq.test(table(data[[nm]], data[[ev]]))
})
# Warning messages:
# 1: In chisq.test(table(data[[nm]], data[[ev]])) :
# Chi-squared approximation may be incorrect
(因為我在測試中使用了不好的示例,所以這里有很多警告;在使用mtcars
時可以忽略此警告,因為它實際上不是該測試的良好數據集。)
summaries <- lapply(models, summary)
str(summaries[1:2])
# List of 2
# $ : 'summaryDefault' chr [1:9, 1:3] " 1" " 1" " 1" " 1" ...
# ..- attr(*, "dimnames")=List of 2
# .. ..$ : chr [1:9] "statistic" "parameter" "p.value" "method" ...
# .. ..$ : chr [1:3] "Length" "Class" "Mode"
# $ : 'summaryDefault' chr [1:9, 1:3] " 1" " 1" " 1" " 1" ...
# ..- attr(*, "dimnames")=List of 2
# .. ..$ : chr [1:9] "statistic" "parameter" "p.value" "method" ...
# .. ..$ : chr [1:3] "Length" "Class" "Mode"
假設您的數據就像mtcars
,其中vs
, am
, gear
和carb
是分類變量,則可以這樣創建一個函數:
df_list_f <- function(x) chisq.test(table(df2$cyl, x))
df2 <- mtcars[,8:11] # df2 contains the columns vs, am, gear and carb
lapply(df2, df_list_f)
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