在Dockerfile中為R添加CRAN鏡像/ PPA

Question

我正在編寫Dockerfile，並想知道如何使用R的預編譯cran軟件包正確添加ppa。我的以下代碼給出了錯誤消息：

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W：儲存庫“ http://ppa.launchpad.net/marutter/c2d4u/ubuntu cosmic Release”沒有發布文件。
E：無法獲取http://ppa.launchpad.net/marutter/c2d4u/ubuntu/dists/cosmic/main/binary-amd64/Packages 404找不到
E：某些索引文件下載失敗。 它們已被忽略，或改用舊的。

盡管我可以在此處找到Release文件，但我不理解他為什么找不到它。

我的基本圖像是postgres，您可以將其拉為

docker pull postgres

在添加PPA后調用RUN apt-get update時遇到錯誤：

# Load base image
FROM postgres

RUN apt-get update && \
    apt-get install -y software-properties-common && \
    apt-get install -y apt-transport-https

RUN apt-get update
RUN apt-get install -y wget
# More stuff here
RUN apt-get install -y r-base r-base-dev 

# add cran mirror
RUN apt-key adv --keyserver keyserver.ubuntu.com --recv-keys E084DAB9
RUN echo "deb-src https://cran.rstudio.com/bin/linux/ubuntu xenial/" | tee -a /etc/apt/sources.list

# add PPA with pre-compiled cran packages
RUN add-apt-repository -y ppa:marutter/c2d4u 

# install some R packages
RUN apt-get update
RUN apt-get install -y r-cran-data.table
RUN apt-get install -y r-cran-tidyverse 

如果我不打電話給RUN apt-get update他不會找到tidyverse （但會找到data.table ）

Answer 1

根本的問題是，當您嘗試添加用於Ubuntu的映像時， postgres映像基於Debain stable。 我看到三種可能的方法：

• 盡可能通過postgres映像使用Debian穩定版，並從源代碼安裝缺少的tidyverse軟件包。

• 通過postgres映像將Debian穩定版與R 3.5的CRAN反向端口一起使用，並從源代碼編譯所有軟件包

• 使用Ubuntu映像加上c2d4u（例如https://hub.docker.com/r/rocker/r-apt/ ），並在其上添加postgres。

Answer 2

我相信您的Dockerfile中有一個錯字。

RUN echo "deb-src https://cran.rstudio.com/bin/linux/ubuntu xenial/" | tee -a /etc/apt/sources.list

應該

RUN echo "deb-src https://cran.rstudio.com/bin/linux/ubuntu/xenial/" | tee -a /etc/apt/sources.list

這能解決您的問題嗎？