使用“conda”從 github 安裝 R 包

Question

任何人都可以建議如何在 Linux 中使用conda從 github 安裝 R 包？

謝謝！

Answer 1

根據此： https ://github.com/conda/conda/issues/6674 您可以創建自己的 github 派生 R 包的 conda 框架，就像創建 CRAN 包一樣。

嘗試做

conda skeleton cran <github_url>

conda build --R=<my_r_version> r-<lower-case-package-name>

然后將構建好的conda包上傳到自己的anaconda倉庫中。 如果您有權訪問的 anaconda 存儲庫中缺少包的任何依賴項，這將失敗。 因此，您可能必須在此過程中使用 conda-build 構建一些其他包。

或者，您可以直接使用devtools::install_github(github_url, dependencies = FALSE)安裝它。 如果你確實走這條路，請確保已經安裝了 github 包的任何可用的 conda 依賴項。

如果你不使用dependencies = FALSE R 將安裝install.packages一堆更新。 （據我所知）當你 install.packages 一個預安裝的包some_package在一個 conda 環境中（例如，更新它）然后檢查你當前環境中的conda list <some_package> ，它會顯示那個版本由 conda 安裝，而不是更新版本。

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按照@rpanai 的建議編輯構建命令