使用“conda”从 github 安装 R 包

Question

任何人都可以建议如何在 Linux 中使用conda从 github 安装 R 包？

谢谢！

Answer 1

根据此： https ://github.com/conda/conda/issues/6674 您可以创建自己的 github 派生 R 包的 conda 框架，就像创建 CRAN 包一样。

尝试做

conda skeleton cran <github_url>

conda build --R=<my_r_version> r-<lower-case-package-name>

然后将构建好的conda包上传到自己的anaconda仓库中。 如果您有权访问的 anaconda 存储库中缺少包的任何依赖项，这将失败。 因此，您可能必须在此过程中使用 conda-build 构建一些其他包。

或者，您可以直接使用devtools::install_github(github_url, dependencies = FALSE)安装它。 如果你确实走这条路，请确保已经安装了 github 包的任何可用的 conda 依赖项。

如果你不使用dependencies = FALSE R 将安装install.packages一堆更新。 （据我所知）当你 install.packages 一个预安装的包some_package在一个 conda 环境中（例如，更新它）然后检查你当前环境中的conda list <some_package> ，它会显示那个版本由 conda 安装，而不是更新版本。

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按照@rpanai 的建议编辑构建命令