如何重命名多個文件中的多個列？

Question

我有多個文件，看起來像這樣：

trans_ENSG00000047849.txt.traw
trans_ENSG00000047848.txt.traw
trans_ENSG00000047847.txt.traw
...

其中我有大約 300 列，列名如下所示：

NA20826_NA20826 NA20828_NA20828 NA20819_NA20819

我希望所有文件中的列名都改為這種形式：

NA20826 NA20828 NA20819

換句話說，我想刪除每個列名和每個文件中下划線 _ 之后的所有內容。

我應該提到的是，每個文件的開頭都有一個制表符空間。

我試過這個：

sed -ri 's/[_].*$//' trans_*.txt.traw

但是當我嘗試在 RI 中打開這些轉換后的文件之一時出現此錯誤：

> e=read.table("trans_ENSG00000135541.txt.traw", header=TRUE)
Error in read.table("trans_ENSG00000135541.txt.traw", header = TRUE) : 
  more columns than column names

Answer 1

我猜你真的想要這個：

$ echo -e "\tNA20826_NA20826\tNA20828_NA20828\tNA20819_NA20819" | sed -r '1s/_[^\t]*//g'
        NA20826 NA20828 NA20819

_[^\\t]*因為它是TAB分隔的，所以從_開始到TAB之前（或行尾）是要刪除的東西。
g標志是替換所有出現的行。
第1是限制在第一線更換-標題行。

你自己的ubstitude 命令's/[_].*$//' ，是從第一個_到行尾替換，所以它最終只剩下一個標題。

Answer 2

您需要的 sed 命令是：

sed -ri 's/_\S*//g'

無論每行有多少列，此正則表達式都會刪除每個單詞的一部分，從下划線開始直到下一個空格或制表符。