使用python運行bash_profile命令

Question

在我的bash終端中，我可以運行以下命令：

$SCHRODINGER/run volume_calc.py -imae type.mae

這可以正常工作。

然后，我嘗試在python腳本中運行相同的命令； 我嘗試了以下方法：

import subprocess
subprocess.run(['$SCHRODINGER/run', 'volume_calc.py', '-imae', 'type.mae'])

引發錯誤：

FileNotFoundError: [Errno 2] No such file or directory: '$SCHRODINGER/run'

我很困惑這個問題可能是什么，因為我可以很好地運行基本的bash命令。 感謝您的任何幫助。

Answer 1

除非您將shell參數傳遞給subprocess.run調用，否則默認情況下不會使用子進程來完成環境變量的擴展。 這會將您的參數傳遞給外殼程序（例如bash ），該外殼程序將處理所需的擴展以及任何其他類似外殼程序的功能。

這是必要的代碼更改：

subprocess.run(['$SCHRODINGER/run', 'volume_calc.py', '-imae', 'type.mae'], shell=True)

請注意，值得閱讀使用python文檔中給出的安全注意事項 。