如何在非系統范圍內的gdal安裝中在R中安裝rgdal軟件包

Question

我在沒有管理權限的Linux機器上，我需要安裝rgdal軟件包。 我已經從源代碼編譯了gdal並將其安裝在我有權訪問的自定義文件夾中。 當我嘗試使用以下方法安裝rgdal時：

install.packages("rgdal", lib = "libs")

我得到：

* installing *source* package ‘rgdal’ ...
** package ‘rgdal’ successfully unpacked and MD5 sums checked
ERROR: 'configure' exists but is not executable -- see the 'R Installation and Administration Manual'

這是因為它正在尋找系統范圍的gdal（dev）安裝。 如何指定我的gdal已安裝在其他位置？

我嘗試添加：

configure.args = "--libdir=/home/user/opt/gdal"

但無濟於事。

謝謝

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根據評論中的討論內容編輯2019-04-16

libgdal-dev現在由sysadmin安裝。 嘗試安裝rgdal時仍收到以下錯誤：

 * installing source package ‘rgdal’ ... 
** package ‘rgdal’ successfully unpacked and MD5 sums checked ERROR: 'configure' exists but is not executable -- see the 'R Installation and Administration Manual' 
* removing ‘/home/leomarg/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.4/rgdal’ 
Warning in install.packages : installation of package ‘rgdal’ had non-zero exit status

Answer 1

您的/tmp目錄可能沒有必要的執行權限。

創建一個用戶特定的tmp目錄並將其添加到您的路徑中：

mkdir ~/tmp
export TMPDIR=~/tmp

資料來源： https : //www.r-bloggers.com/using-r-package-installation-problems/