網狀無法安裝python包

Question

我正在嘗試在 RStudio 中運行 Seurat 管道（Windows 10，需要安裝 python 庫“umap-learn”（Seurat 演練： https : //satijalab.org/seurat/v3.0/pbmc3k_tutorial.html ）。

要安裝所述庫，我以下列方式在 R 中使用網狀庫：

library(reticulate)
py_install(packages = 'umap-learn')

我收到以下錯誤：

Error in conda_python(envname = envname, conda = conda) : 
  conda environment r-reticulate not found

我已經嘗試了幾乎所有我能想到的：

• 直接為 py_install 提供 python 的路徑
• 卸載/重新安裝 RStudio
• 卸載/重新安裝 Anaconda
• 嘗試將 Anaconda 添加到系統路徑
• 使用開發工具版本的 Reticulate
• 使用 use_python 函數：use_python("C://Users/lvlah/Anaconda3/python.exe")

在我的智慧結束時 - 我的同事都沒有遇到過這個問題。 任何幫助，將不勝感激。

Answer 1

我遇到了同樣的問題，似乎有問題的是您需要首先手動創建r-reticulate環境。 我是在 Anaconda Navigator 中手動完成的，但您也可以在 R 中執行conda_create("r-reticulate") ，如本教程中所述。

Answer 2

我遇到了完全相同的問題，在找到這篇有用的帖子后，我通過安裝 OpenSSL 解決了這個問題。 希望這對你有用！