如何使用多處理來加速以下功能？

Question

我有以下for循環：

for j in range(len(a_nested_list_of_ints)):
    arr_1_, arr_2_, arr_3_ = foo(a_nested_list_of_ints[j])
    arr_1[j,:] = arr_1_.data.numpy()
    arr_2[j,:] = arr_2_.data.numpy()
    arr_3[j,:] = arr_3_.data.numpy()

其中a_nested_list_of_ints是一個嵌套的int列表。 但是要花很多時間才能完成。 如何通過多處理優化它？ 到目前為止，我嘗試使用multiprocessing

p = Pool(5)
for j in range(len(a_nested_list_of_ints)):
    arr_1_, arr_2_, arr_3_ = p.map(foo,a_nested_list_of_ints[j])
    arr_1[j,:] = arr_1_.data.numpy()
    arr_2[j,:] = arr_2_.data.numpy()
    arr_3[j,:] = arr_3_.data.numpy()

但是，我得到了：

ValueError: not enough values to unpack (expected 3, got 2)

這里：

    arr_1_, arr_2_, arr_3_ = p.map(foo,a_nested_list_of_ints[j])

如何更快地完成上述操作？ 我甚至嘗試過使用starmap，但它不起作用。

Answer 1

這是一個有效的pool演示：

In [11]: def foo(i): 
    ...:     return np.arange(i), np.arange(10-i) 
    ...:                                                                        
In [12]: with multiprocessing.Pool(processes=2) as pool: 
    ...:     x = pool.map(foo, range(10)) 
    ...:                                                                        
In [13]: x                                                                      
Out[13]: 
[(array([], dtype=int64), array([0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9])),
 (array([0]), array([0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8])),
 (array([0, 1]), array([0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7])),
 (array([0, 1, 2]), array([0, 1, 2, 3, 4, 5, 6])),
 (array([0, 1, 2, 3]), array([0, 1, 2, 3, 4, 5])),
 (array([0, 1, 2, 3, 4]), array([0, 1, 2, 3, 4])),
 (array([0, 1, 2, 3, 4, 5]), array([0, 1, 2, 3])),
 (array([0, 1, 2, 3, 4, 5, 6]), array([0, 1, 2])),
 (array([0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7]), array([0, 1])),
 (array([0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8]), array([0]))]

pool.map正在進行迭代，而不是一些外部for循環。

並且更接近你的例子：

In [14]: def foo(alist): 
    ...:     return np.arange(*alist), np.zeros(alist,int) 
    ...:      
    ...:                                                                        
In [15]: alists=[(0,3),(1,4),(1,6,2)]                                           
In [16]: with multiprocessing.Pool(processes=2) as pool: 
    ...:     x = pool.map(foo, alists) 
    ...:                                                                        
In [17]: x                                                                      
Out[17]: 
[(array([0, 1, 2]), array([], shape=(0, 3), dtype=int64)),
 (array([1, 2, 3]), array([[0, 0, 0, 0]])),
 (array([1, 3, 5]), array([[[0, 0],
          [0, 0],
          [0, 0],
          [0, 0],
          [0, 0],
          [0, 0]]]))]

請注意， pool.map返回一個列表，其中包含從alists生成的所有案例。 解壓縮x是沒有意義的。

 x,y = pool.map(...)   # too many values to pack error

我可以使用zip*成語解壓縮x ：

In [21]: list(zip(*x))                                                          
Out[21]: 
[(array([0, 1, 2]), array([1, 2, 3]), array([1, 3, 5])),
 (array([], shape=(0, 3), dtype=int64), array([[0, 0, 0, 0]]), array([[[0, 0],
          [0, 0],
          [0, 0],
          [0, 0],
          [0, 0],
          [0, 0]]]))]

這是一個2元組的列表; 實際上是轉置的列表版本。 這可以解壓縮：

In [23]: y,z = zip(*x)                                                          
In [24]: y                                                                      
Out[24]: (array([0, 1, 2]), array([1, 2, 3]), array([1, 3, 5]))
In [25]: z                                                                      
Out[25]: 
(array([], shape=(0, 3), dtype=int64), array([[0, 0, 0, 0]]), array([[[0, 0],
         [0, 0],
         [0, 0],
         [0, 0],
         [0, 0],
         [0, 0]]]))

Answer 2

這是我經常使用的多處理實現。 它會將您的列表（在本例中為a_nested_list_of_ints ）拆分為您擁有的多個核心。 然后它在每個拆分列表上運行你的foo函數，每個核心一個列表。

def split_list(all_params, instances):
    return list(np.array_split(all_params, instances))

# split the list up into equal chucks for each core
n_proc = multiprocessing.cpu_count()
split_items = split_list(to_calc, n_proc)

# create the multiprocessing pool
pool = Pool(processes=n_proc)
all_calcs = []
for i in range(n_proc):
    # the arguments to the foo definition have to be a tuple - (split[i],)
    async_calc = pool.apply_async(foo, (split_items[i],))
    all_calcs.append(async_calc)

pool.close()
pool.join()

# get results
all_results = []
for result in all_calcs:
    all_results += result.get()

print(all_results)