匹配錯誤（x，表，nomatch = 0L）：“匹配”需要向量參數

Question

我正在嘗試在 R studio cloud 上做一些 Bioconductor 練習。 運行前兩個代碼 (#1,#2) 沒問題，但最后一個代碼 (#3) 給出了錯誤消息。 請問有人可以幫忙嗎？

#1 Transcribe dna_seq into an RNAString object and print it
 dna_seq <- subseq(unlist(zikaVirus), end = 21)
 dna_seq
  21-letter "DNAString" instance
seq: AGTTGTTGATCTGTGTGAGTC



#2 Transcribe dna_seq into an RNAString object and print it
 rna_seq <- RNAString(dna_seq) 
 rna_seq
  21-letter "RNAString" instance
seq: AGUUGUUGAUCUGUGUGAGUC

#3 Translate rna_seq into an AAString object and print it
aa_seq <- translate(rna_seq)
aa_seq

 aa_seq <- translate(rna_seq)

匹配錯誤（x，表，nomatch = 0L）：“匹配”需要向量參數 aa_seq 錯誤：找不到對象“aa_seq”

Answer 1

謝謝你。 我設法解決了這個問題：我認為與 translate() 函數存在沖突，因為 seqinr 和 Biostring 包都使用了它（我都加載了）。 我不得不卸載 seqinr，因為我正在做的練習是基於 Biostring 包的。