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匹配错误(x,表,nomatch = 0L):“匹配”需要向量参数

[英]Error in match(x, table, nomatch = 0L) : 'match' requires vector arguments

我正在尝试在 R studio cloud 上做一些 Bioconductor 练习。 运行前两个代码 (#1,#2) 没问题,但最后一个代码 (#3) 给出了错误消息。 请问有人可以帮忙吗?

#1 Transcribe dna_seq into an RNAString object and print it
 dna_seq <- subseq(unlist(zikaVirus), end = 21)
 dna_seq
  21-letter "DNAString" instance
seq: AGTTGTTGATCTGTGTGAGTC



#2 Transcribe dna_seq into an RNAString object and print it
 rna_seq <- RNAString(dna_seq) 
 rna_seq
  21-letter "RNAString" instance
seq: AGUUGUUGAUCUGUGUGAGUC

#3 Translate rna_seq into an AAString object and print it
aa_seq <- translate(rna_seq)
aa_seq

 aa_seq <- translate(rna_seq)

匹配错误(x,表,nomatch = 0L):“匹配”需要向量参数 aa_seq 错误:找不到对象“aa_seq”

谢谢你。 我设法解决了这个问题:我认为与 translate() 函数存在冲突,因为 seqinr 和 Biostring 包都使用了它(我都加载了)。 我不得不卸载 seqinr,因为我正在做的练习是基于 Biostring 包的。

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