如何在大矩陣中組合具有相似名稱的列

Question

我正在嘗試使用 R studio 組合微生物數據矩陣中的列。 當我將我的 .csv 導入 R 時，如下所示：

        species.1   taxa.1   species.2   another.1  taxa.2
ind1    2           4        2           4          3
ind2    4           2        6           3          0

我希望它看起來像：

       species    taxa    another
ind1   4          7       4
ind2   10         2       3

我已經看到不同的代碼可以讓我在小范圍內做到這一點，但我需要一些東西來幫助我協調大數據集（54x521）。

Answer 1

假設您的矩陣稱為 dt，您可以這樣做：

使用基礎 R，你可以做

sapply(split.default(data.frame(dt),sub("\\..*","",colnames(dt))),rowSums)

     another species taxa
ind1       4       4    7
ind2       3      10    2