用 R 中的置信區間繪制平行坐標

Question

是否有 R 包允許繪制具有置信區間的平行坐標？ 就像下面的例子。

或者什么是最簡單的選擇？ 制作多個ggplots並與ggarrange或patchwork並排打印？

生成的數據

library(tidyverse)

set.seed(1)

#make new data
df = tibble(
  factor= c("A", "B", "C", "D", "E", "F", "G", "H", "I", "J", "K", "L", "M", "N", "O"),
  var1 = rnorm(15, 50, 20),
  var2 = rnorm(15, 10, 4),
  var3 = rnorm(15, 2, 1))

#add confidence intervals
df = df %>% mutate(
  var1_lower = var1 - runif(1, 5, 15),
  var1_upper = var1 + runif(1, 5, 15),
  var2_lower = var2 - runif(1, 0.5, 2.2),
  var2_upper = var2 +  runif(1, 0.5, 2.2),
  var3_lower = var3 - runif(1, 0.1, 0.6),
  var3_upper = var3 + runif(1, 0.1, 0.6))

#reorder columns
df = df[c("factor", "var1", "var1_lower", "var1_upper", "var2", "var2_lower", "var2_upper", "var3", "var3_lower", "var3_upper")]

Answer 1

有兩個庫可讓您繪制平行坐標圖。

1. GGally
2. 大量的
3. 格帕奇

我相信 ggparci 最適合您的問題。 因為它允許您用數據繪制置信區間。 我在上面的評論中給出了圖書館文檔的鏈接。

但是，我提到休息二是為了每個人的利益。

在 GGally 庫中，您可以使用

ggparcoord(df, columns=1:10, groupColum = 5)

GGally 具有用於進一步處理繪圖的比例選項。

我在沒有任何處理的情況下繪制了 df ，它看起來像：

在 MASS 庫中有一個名為parcoord()的函數

使用示例：

# MASS library
library(MASS)

# Color
color <- colors()[as.numeric(iris$Species)*11]

# Plot
parcoord(iris[,c(1:4)] , col= color)