ggplot 箱線圖，按組顯示均值和置信區間

Question

我想用均值而不是中值制作箱線圖。 此外，我希望這條線停在 5%（下）結束 95%（上）分位數。 這里的代碼；

ggplot(data, aes(x=Cement, y=Mean_Gap, fill=Material)) +
geom_boxplot(fatten = NULL,aes(fill=Material), position=position_dodge(.9)) +
xlab("Cement") + ylab("Mean cement layer thickness") +
stat_summary(fun=mean, geom="point", aes(group=Material), position=position_dodge(.9),color="black")

我想將geom更改為errorbar ，但這不起作用。 我試過middle = mean(Mean_Gap) ，但這也不起作用。 我試過ymin = quantile(y,0.05) ，但沒有任何改變。 誰能幫我？

使用 ggplot 的標准箱線圖。 填充是材料：

Answer 1

以下是如何使用框和須線的自定義參數創建箱線圖。 這是@lukeA 在stackoverflow.com/a/34529614/6288065 中顯示的解決方案，但這個解決方案還將向您展示如何按組制作多個盒子。

名為“ToothGrowth”的 R 內置數據集與您的數據結構相似，因此我將以此為例。 我們將繪制每個維生素 C 補充劑組 ( supp ) 的牙齒生長長度 ( len )，按劑量水平 ( dose ) 分隔/填充。

# "ToothGrowth" at a glance
head(ToothGrowth)
#   len supp dose
#1  4.2   VC  0.5
#2 11.5   VC  0.5
#3  7.3   VC  0.5
#4  5.8   VC  0.5
#5  6.4   VC  0.5
#6 10.0   VC  0.5


library(dplyr)

# recreate the data structure with specific "len" coordinates to plot for each group
df <- ToothGrowth %>% 
    group_by(supp, dose) %>% 
    summarise(
        y0 = quantile(len, 0.05), 
        y25 = quantile(len, 0.25), 
        y50 = mean(len), 
        y75 = quantile(len, 0.75), 
        y100 = quantile(len, 0.95))

df
## A tibble: 6 x 7
## Groups:   supp [2]
#  supp   dose    y0   y25   y50   y75  y100
#  <fct> <dbl> <dbl> <dbl> <dbl> <dbl> <dbl>
#1 OJ      0.5  8.74  9.7  13.2   16.2  19.7
#2 OJ      1   16.8  20.3  22.7   25.6  26.9
#3 OJ      2   22.7  24.6  26.1   27.1  30.2
#4 VC      0.5  4.65  5.95  7.98  10.9  11.4
#5 VC      1   14.0  15.3  16.8   17.3  20.8
#6 VC      2   19.8  23.4  26.1   28.8  33.3

# boxplot using the mean for the middle and 95% quantiles for the whiskers
ggplot(df, aes(supp, fill = as.factor(dose))) +
    geom_boxplot(
        aes(ymin = y0, lower = y25, middle = y50, upper = y75, ymax = y100),
        stat = "identity"
    ) + 
    labs(y = "len", title = "Boxplot with Mean Middle Line") + 
    theme(plot.title = element_text(hjust = 0.5))

在上圖中，左側的箱線圖是具有規則中線和規則最小/最大須線的標准箱線圖。
右側的箱線圖使用平均中線和 5%/95% 分位數須。