我正在使用 seaborn 並有一個熱圖。 如何從離散范圍創建具有特定 colors 的顏色圖？

Question

我正在制作 seaborn 熱量 map 並且我想指定具有這些范圍的離散顏色圖：

under 40 = dark green
40 - 70 = light green
70 - 130 = white
130 - 165 = light red
165 and over = dark red

我制作了一個具有正確邊界的顏色條：

fig, ax = plt.subplots(figsize=(6, 1))
fig.subplots_adjust(bottom=0.5)

cmap = mpl.colors.ListedColormap(['darkolivegreen', 'yellowgreen', 'white', 'lightcoral','darkred'])
#cmap.set_over('0.25')
#cmap.set_under('0.75')
bounds = [0, 40, 70, 130,165,310]
norm = mpl.colors.BoundaryNorm(bounds, cmap.N)
cb2 = mpl.colorbar.ColorbarBase(ax, cmap=cmap,
                                norm=norm,
                                #boundaries=[0] + bounds + [13],
                                extend='both',
                                ticks=bounds,
                                spacing='proportional',
                                orientation='horizontal')
cb2.set_label('Discrete intervals, some other units')
fig.show()

我現在的問題是如何定義這個帶有邊界的顏色條作為我的 seaborn 熱圖的新顏色圖？

我試過這個，但邊界不存在，顏色圖被均勻調整，而不是使用特定的邊界。

ax = sns.heatmap(selected,cmap=cmap)
plt.ylabel('Patient')
plt.xlabel('Gene')
#ax.set_yticks(np.arange(0,61,1))
plt.show()

如何根據我定義的新顏色條獲得正確的顏色圖？

Answer 1

您可以在繪制熱圖后嘗試使用plt.colorbar到 plot 彩條

fig, ax = plt.subplots(figsize=(6, 9))
fig.subplots_adjust(bottom=0.5)

# define the color map
cmap = mpl.colors.ListedColormap(['darkolivegreen', 'yellowgreen', 'white', 'lightcoral','darkred'])
bounds = [0, 40, 70, 130,165,310]
norm = mpl.colors.BoundaryNorm(bounds, cmap.N)

# plot heatmap with `imshow`
cb = ax.imshow(selected,cmap=cmap, norm=norm)

# plot colorbar
cb2 = plt.colorbar(cb, #boundaries=[0] + bounds + [13],
                                extend='both',
                                ticks=bounds,
                                spacing='proportional',
                                orientation='horizontal')
cb2.set_label('Discrete intervals, some other units')
fig.show()

Output：