[英]The behavior of the knitr button in RStudio when rendering an Rmd file sitting inside a blogdown static folder
我有一個要轉換為 pdf 文件的 Rmd 文件。 目前它位於“靜態”文件夾的子文件夾中,該文件夾是我的博客站點結構的一部分,由 blogdown package 創建。 問題是,當我點擊 RStudio 中的“編織”按鈕時,它會調用rmarkdown::render_site(...)
而我期待rmarkdown::render(...)
。 我確實有一個文件R/build.R
有一行命令blogdown::build_dir("static")
所以這對我來說很奇怪。 當我嘗試轉換不同文件夾中的其他 Rmd 文件(與我的博客文件夾/文件無關)時,一切都按預期工作得很好。
為了得到我想要的,我目前正在控制台中輸入rmarkdown::render("myfile.Rmd")
,或者我正在使用無限月亮閱讀器,但都沒有“Knit”按鈕那么方便:(
以下是來自xfun::session_info('blogdown')
的 output 將 blogdown package 更新到 1.1 版后:
> xfun::session_info('blogdown')
R version 4.0.3 (2020-10-10)
Platform: x86_64-w64-mingw32/x64 (64-bit)
Running under: Windows 10 x64 (build 18363), RStudio 1.4.1103
Locale:
LC_COLLATE=English_United States.1252 LC_CTYPE=English_United States.1252 LC_MONETARY=English_United States.1252
LC_NUMERIC=C LC_TIME=English_United States.1252
Package version:
base64enc_0.1.3 BH_1.75.0.0 blogdown_1.1 bookdown_0.21 digest_0.6.27 evaluate_0.14 glue_1.4.2
graphics_4.0.3 grDevices_4.0.3 highr_0.8 htmltools_0.5.0 httpuv_1.5.4 jsonlite_1.7.2 knitr_1.30
later_1.1.0.1 magrittr_2.0.1 markdown_1.1 methods_4.0.3 mime_0.9 promises_1.1.1 R6_2.5.0
Rcpp_1.0.5 rlang_0.4.9 rmarkdown_2.6 servr_0.21 stats_4.0.3 stringi_1.5.3 stringr_1.4.0
tinytex_0.29 tools_4.0.3 utils_4.0.3 xfun_0.20 yaml_2.2.1
編輯:我不確定這是否有幫助,但我想轉換為 pdf 的HW3.Rmd
文件如下所示:
---
title: "Homework 3"
subtitle: "due Feb 2, 2021"
output:
pdf_document: default
---
```{r}
1 + 1
```
當我將此文件保存在C:/Users/jungl/Dropbox/GitHub/blog2020/static/Drexel_2021/HW3.Rmd
中的文件夾中時(這里C:/Users/jungl/Dropbox/GitHub/blog2020
所有由 blogdown 創建的文件夾/文件),“Knit”按鈕意外調用rmarkdown::render_site(...)
。 但是,當我在文件夾中復制與HW3.Rmd
C:/Users/jungl/Dropbox/test/HW3.Rmd
相同的 HW3.Rmd 時,“Knit”按鈕按預期工作並調用rmarkdown::render(...)
。 所以它看起來像 RStudio 的“Knit”按鈕以某種方式自動確定它是否應該根據工作中的rmarkdown::render_site(...)
文件是否位於rmarkdown::render(...)
sub) 包含 blogdown 生成的文件夾/文件的根文件夾的文件夾。
編輯:Github 存儲庫位於https://github.com/junglee0713/blog2020
,我剛剛檢查過同樣的問題仍然存在。 我要轉換為 PDF 的HW3.Rmd
文件位於https://github.com/junglee0713/blog2020/tree/master/static/Drexel_2021
另一個編輯:安裝blogdown的開發版本似乎解決了這個問題(下面的輸出,注意它仍然調用rmarkdown::render_site(...)
),但有另一個問題。 它將同一目錄中的其他 Rmd 文件(例如HW1.Rmd
和HW2.Rmd
)渲染到相應的 PDF 文件中。
==> rmarkdown::render_site('C:/Users/jungl/Dropbox/GitHub/blog2020/static/Drexel_2021/HW3.Rmd', encoding = 'UTF-8');
|.................. | 25%
ordinary text without R code
|................................... | 50%
label: setup (with options)
List of 1
$ include: logi FALSE
processing file: HW3.Rmd
|.................................................... | 75%
ordinary text without R code
|......................................................................| 100%
label: unnamed-chunk-1 (with options)
List of 1
$ eval: symbol F
"C:/Program Files/RStudio/bin/pandoc/pandoc" +RTS -K512m -RTS HW3.utf8.md --to latex --from markdown+autolink_bare_uris+tex_math_single_backslash --output HW3.tex --lua-filter "C:\Users\jungl\Documents\R\win-library\4.0\rmarkdown\rmarkdown\lua\pagebreak.lua" --lua-filter "C:\Users\jungl\Documents\R\win-library\4.0\rmarkdown\rmarkdown\lua\latex-div.lua" --self-contained --highlight-style tango --pdf-engine pdflatex --variable graphics --variable "geometry:margin=1in"
output file: HW3.knit.md
Output created: HW3.pdf
`stat_bin()` using `bins = 30`. Pick better value with `binwidth`.
So each time I render HW3.Rmd
to a PDF, I get unsolicited updates of HW1.pdf
and HW2.pdf
too (as you see, I don't have any ggplot figure in HW3.Rmd
and the output warns about picking better value與HW2.Rmd
中確實有geom_histogram()
)。 對我來說更有趣的是,在HW1.Rmd
、 HW2.Rmd
和HW3.Rmd
所在的文件夾中,還有其他 Rmd 文件我轉換為 HTML (比如Drexel_2021_Lecture_1.Rmd
、 Drexel_2021_Lecture_2.Rmd
和Drexel_2021_Lecture_3.Rmd
- 它們是 xaringan 幻燈片)並且它們不會受到針織的影響。
當您單擊“Knit”按鈕時, blogdown確實首先調用rmarkdown::render_site()
,但是這個 function 實際上最終調用rmarkdown::render()
。
如果單擊 Knit 按鈕時它沒有將您的 Rmd 文件編譯為 PDF,請確保您使用的是最新版本的blogdown ,因為這聽起來像是我幾個月前修復的錯誤(如有疑問,請嘗試更新軟件包)。
如果安裝當前開發版的blogdown (安裝后重啟R):
install.packages('blogdown', repos = c(
rstudio = 'https://rstudio.r-universe.dev',
CRAN = 'https://cloud.r-project.org'
))
當您單擊編織按鈕時,您將在 R Markdown 選項卡中看到編織的詳細日志:
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