[英]The behavior of the knitr button in RStudio when rendering an Rmd file sitting inside a blogdown static folder
我有一个要转换为 pdf 文件的 Rmd 文件。 目前它位于“静态”文件夹的子文件夹中,该文件夹是我的博客站点结构的一部分,由 blogdown package 创建。 问题是,当我点击 RStudio 中的“编织”按钮时,它会调用rmarkdown::render_site(...)
而我期待rmarkdown::render(...)
。 我确实有一个文件R/build.R
有一行命令blogdown::build_dir("static")
所以这对我来说很奇怪。 当我尝试转换不同文件夹中的其他 Rmd 文件(与我的博客文件夹/文件无关)时,一切都按预期工作得很好。
为了得到我想要的,我目前正在控制台中输入rmarkdown::render("myfile.Rmd")
,或者我正在使用无限月亮阅读器,但都没有“Knit”按钮那么方便:(
以下是来自xfun::session_info('blogdown')
的 output 将 blogdown package 更新到 1.1 版后:
> xfun::session_info('blogdown')
R version 4.0.3 (2020-10-10)
Platform: x86_64-w64-mingw32/x64 (64-bit)
Running under: Windows 10 x64 (build 18363), RStudio 1.4.1103
Locale:
LC_COLLATE=English_United States.1252 LC_CTYPE=English_United States.1252 LC_MONETARY=English_United States.1252
LC_NUMERIC=C LC_TIME=English_United States.1252
Package version:
base64enc_0.1.3 BH_1.75.0.0 blogdown_1.1 bookdown_0.21 digest_0.6.27 evaluate_0.14 glue_1.4.2
graphics_4.0.3 grDevices_4.0.3 highr_0.8 htmltools_0.5.0 httpuv_1.5.4 jsonlite_1.7.2 knitr_1.30
later_1.1.0.1 magrittr_2.0.1 markdown_1.1 methods_4.0.3 mime_0.9 promises_1.1.1 R6_2.5.0
Rcpp_1.0.5 rlang_0.4.9 rmarkdown_2.6 servr_0.21 stats_4.0.3 stringi_1.5.3 stringr_1.4.0
tinytex_0.29 tools_4.0.3 utils_4.0.3 xfun_0.20 yaml_2.2.1
编辑:我不确定这是否有帮助,但我想转换为 pdf 的HW3.Rmd
文件如下所示:
---
title: "Homework 3"
subtitle: "due Feb 2, 2021"
output:
pdf_document: default
---
```{r}
1 + 1
```
当我将此文件保存在C:/Users/jungl/Dropbox/GitHub/blog2020/static/Drexel_2021/HW3.Rmd
中的文件夹中时(这里C:/Users/jungl/Dropbox/GitHub/blog2020
所有由 blogdown 创建的文件夹/文件),“Knit”按钮意外调用rmarkdown::render_site(...)
。 但是,当我在文件夹中复制与HW3.Rmd
C:/Users/jungl/Dropbox/test/HW3.Rmd
相同的 HW3.Rmd 时,“Knit”按钮按预期工作并调用rmarkdown::render(...)
。 所以它看起来像 RStudio 的“Knit”按钮以某种方式自动确定它是否应该根据工作中的rmarkdown::render_site(...)
文件是否位于rmarkdown::render(...)
sub) 包含 blogdown 生成的文件夹/文件的根文件夹的文件夹。
编辑:Github 存储库位于https://github.com/junglee0713/blog2020
,我刚刚检查过同样的问题仍然存在。 我要转换为 PDF 的HW3.Rmd
文件位于https://github.com/junglee0713/blog2020/tree/master/static/Drexel_2021
另一个编辑:安装blogdown的开发版本似乎解决了这个问题(下面的输出,注意它仍然调用rmarkdown::render_site(...)
),但有另一个问题。 它将同一目录中的其他 Rmd 文件(例如HW1.Rmd
和HW2.Rmd
)渲染到相应的 PDF 文件中。
==> rmarkdown::render_site('C:/Users/jungl/Dropbox/GitHub/blog2020/static/Drexel_2021/HW3.Rmd', encoding = 'UTF-8');
|.................. | 25%
ordinary text without R code
|................................... | 50%
label: setup (with options)
List of 1
$ include: logi FALSE
processing file: HW3.Rmd
|.................................................... | 75%
ordinary text without R code
|......................................................................| 100%
label: unnamed-chunk-1 (with options)
List of 1
$ eval: symbol F
"C:/Program Files/RStudio/bin/pandoc/pandoc" +RTS -K512m -RTS HW3.utf8.md --to latex --from markdown+autolink_bare_uris+tex_math_single_backslash --output HW3.tex --lua-filter "C:\Users\jungl\Documents\R\win-library\4.0\rmarkdown\rmarkdown\lua\pagebreak.lua" --lua-filter "C:\Users\jungl\Documents\R\win-library\4.0\rmarkdown\rmarkdown\lua\latex-div.lua" --self-contained --highlight-style tango --pdf-engine pdflatex --variable graphics --variable "geometry:margin=1in"
output file: HW3.knit.md
Output created: HW3.pdf
`stat_bin()` using `bins = 30`. Pick better value with `binwidth`.
So each time I render HW3.Rmd
to a PDF, I get unsolicited updates of HW1.pdf
and HW2.pdf
too (as you see, I don't have any ggplot figure in HW3.Rmd
and the output warns about picking better value与HW2.Rmd
中确实有geom_histogram()
)。 对我来说更有趣的是,在HW1.Rmd
、 HW2.Rmd
和HW3.Rmd
所在的文件夹中,还有其他 Rmd 文件我转换为 HTML (比如Drexel_2021_Lecture_1.Rmd
、 Drexel_2021_Lecture_2.Rmd
和Drexel_2021_Lecture_3.Rmd
- 它们是 xaringan 幻灯片)并且它们不会受到针织的影响。
当您单击“Knit”按钮时, blogdown确实首先调用rmarkdown::render_site()
,但是这个 function 实际上最终调用rmarkdown::render()
。
如果单击 Knit 按钮时它没有将您的 Rmd 文件编译为 PDF,请确保您使用的是最新版本的blogdown ,因为这听起来像是我几个月前修复的错误(如有疑问,请尝试更新软件包)。
如果安装当前开发版的blogdown (安装后重启R):
install.packages('blogdown', repos = c(
rstudio = 'https://rstudio.r-universe.dev',
CRAN = 'https://cloud.r-project.org'
))
当您单击编织按钮时,您将在 R Markdown 选项卡中看到编织的详细日志:
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