如何生產類似的plot？ [R]

Question

本文的作者 ( https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0092867415006418 ) 在他們的補充文件中提到這些是在 Matlab 中產生的。 由於缺乏熟練度、學習時間和許可證，我試圖在 R 中復制下圖（論文的圖 2，特別是左側的圖 2A ）：

有什么建議么？ 這個 plot 一般叫什么？

謝謝！

Answer 1

對我來說，它看起來像一個經典點 plot：您可以使用 ggplot 在 R 中重現這種 plot：

# Fake dataframe with xy coordinates, type of data (for the coloring), pvalue (for size), and different panel
df <- data.frame(
  x = rep(1:20, 10),
  y = rnorm(200, mean = 0, sd = 2),
  type = rep(rep(LETTERS[1:5], each = 4), 10),
  pvalue = sample(0:50, size = 200, replace = T)/1000,
  panel = sample(rep(paste0("panel", 1:4), each = 50)), 200, replace = F)


# plot
library(ggplot2)
ggplot(df, aes(x, y*x , color = type, size = pvalue)) + geom_hline(yintercept = 0) + geom_point() + facet_wrap(~panel, ncol = 2)

ggsave("demo.png")