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如何使用 Shiny 中的熱圖 package plot 熱圖?

[英]How can I plot a heatmap with the heatmaply package in Shiny?

我正在嘗試使用熱圖 package 以 plot 熱圖並且效果很好。

另一方面,當我嘗試在 Shiny 中執行相同的 plot 時,它不會出現在界面中(當我單擊“運行應用程序”時)。 但是,當我關閉 window 時,plot 突然出現在 R 查看器中。 熱圖 package 是否可能不適用於 Shiny?

這是我的代碼,當我在 R 中使用 plot 時。

library(heatmaply)
x  <- as.matrix(datasets::mtcars)
rc <- colorspace::rainbow_hcl(nrow(x))

heatmaply(
  x[, -c(8, 9)],
  col_side_colors = rc[1:9],
  showticklabels=FALSE,
  Rowv = TRUE,
  Colv = FALSE
)

這是我在 Shiny 中的代碼。

library(shiny)
library(heatmaply)

ui <- fluidPage(

    # Application title
    titlePanel("Heatmap"),

    sidebarLayout(
        sidebarPanel(
            
        ),

        # Show a plot of the generated distribution
        mainPanel(
           plotOutput("distPlot")
        )
    )
)
x  <- as.matrix(datasets::mtcars)
rc <- colorspace::rainbow_hcl(nrow(x))

server <- function(input, output) {

    output$distPlot <- renderPlot({
        heatmaply(
          x[, -c(8, 9)],
          col_side_colors = rc[1:9],
          showticklabels=FALSE,
          Rowv = TRUE,
          Colv = FALSE
        )

     })
}

# Run the application 
shinyApp(ui = ui, server = server) 

我已經嘗試了另一個包來擁有交互式熱圖,但它是唯一一個擁有我想要的東西,因此我需要在這里詢問是否有人知道如何在 Shiny 中使用它。

提前致謝,

問候

您可以使用plotlyOutputrenderPlotly

library(shiny)
library(heatmaply)
library(plotly)

ui <- fluidPage(
  
  # Application title
  titlePanel("Heatmap"),
  
  sidebarLayout(
    sidebarPanel(
      
    ),
    
    # Show a plot of the generated distribution
    mainPanel(
      plotlyOutput("distPlot")
    )
  )
)
x  <- as.matrix(datasets::mtcars)
rc <- colorspace::rainbow_hcl(nrow(x))

server <- function(input, output) {
  
  output$distPlot <- renderPlotly({
    heatmaply(
      x[, -c(8, 9)],
      col_side_colors = rc[1:9],
      showticklabels=FALSE,
      Rowv = TRUE,
      Colv = FALSE
    )
    
  })
}

# Run the application 
shinyApp(ui = ui, server = server) 

在此處輸入圖像描述

還有一個可能感興趣的 package shinyHeatmaply

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