在 R Shiny 應用程序中自定義 heatmaply hover

[英]Customising heatmaply hover in R Shiny app

我在 R Shiny 應用程序中有一個plotlyOutput熱圖，我通過heatmaply渲染它。 當我 hover 鼠標在熱圖上時，我會彈出一個窗口說 我 go 如何將其自定義為自定義字符串？ ...

熱圖中的重疊標簽

[英]Overlapping labels in heatmap

我正在使用“heatmaply”R package 制作熱圖，但我有重疊的行名（見紅色圓圈區域）。 有關解決此問題的任何建議或教程？ 非常感謝！ ...

如何在熱圖 r 中增加與主要 plot 的標簽距離

[英]how to increase labels distance from main plot in heatmaply r

我在 R 的交互式熱圖中有一個簡單的問題。 我不知道如何在 heatmaply 中增加邊距（x 和 y 標簽與主圖之間的距離）？ 我想從熱圖中在ylab（省）中添加一點空間。 有人可以幫助我嗎？ 在此處輸入圖像描述 ...

R 中的熱圖與原始值

[英]Heatmap in R with raw values

我有這個 dataframe： 我想創建一個熱圖，x 軸為患者 ID，y 軸為 clas1、clas2 和 clas3。 熱量 map 中表示的值將是每個“類”的原始值。 在這里我貼一張我想要的圖 很抱歉，因為我沒有更多可用的顏色來表示這一點，但這只是一個示例，可以使用任何色標。 重要的是，我想區分 ...

是否有任何選項可以從 heatmaply in.svg 格式導出熱圖

[英]Is there any option to export the heatmap from heatmaply in .svg format

我想知道是否有任何選項可以以 svg 或 pdf 格式導出熱圖。 ...

如何使用 Shiny 中的熱圖 package plot 熱圖？

[英]How can I plot a heatmap with the heatmaply package in Shiny?

我正在嘗試使用熱圖 package 以 plot 熱圖並且效果很好。 另一方面，當我嘗試在 Shiny 中執行相同的 plot 時，它不會出現在界面中（當我單擊“運行應用程序”時）。 但是，當我關閉 window 時，plot 突然出現在 R 查看器中。 熱圖 package 是否可能不適用於 S ...

如何在 R 中為熱圖的每列添加自定義文本？

[英]How to add custom text per column of a heatmap in R?

我有一個數據集，我正在繪制一個熱圖來比較 7 個組。 我也有每組 2 列描述該組的數據。 我正在嘗試創建一個交互式 plot，它根據每個組的信息列顯示每個組的信息。 這是一個數據示例，其中 7 個組每個有 2 列相應的信息： I am trying to plot groups1-7 (also ...

如何在 R 中使用自定義文本創建交互式熱圖 plot？

[英]How to create an interactive heatmaply plot with custom text in R?

我有一個數據集，我正在繪制一個熱圖來比較 7 個組。 我還在數據 2 列中包含我想作為 hover 文本包含在交互式熱 map 中的信息。 我的數據是要比較的 7 列組，以及要添加到 plot 的 2 列 hover 文本信息。 這些行是我希望比較組之間的顯着性的日志 p 值。 目前我正在嘗試將h ...

有沒有辦法指定要在熱圖中返回的 kmeans 集群的數量

[英]Is there a way to specify number of kmeans clusters to return in heatmaply

我想從heatmaply為我的交互式熱圖返回特定數量的集群，就像我可以使用pheatmap和kmeans_k =參數一樣。 有沒有辦法用heatmaply做到這一點？ 如果我有一個大矩陣並且沒有定義要使用熱圖返回的簇數，則計算熱圖需要很長時間，否則我會收到錯誤消息：“向量 memory 已用盡（達到 ...

是否可以更改熱圖中的列順序？

[英]Is it possible to change the order of columns in heatmaply?

我用來自dendextend package的樹狀圖object創建了一個帶有熱圖的樹狀圖。 我想知道是否有辦法更改列的順序：vs、am、carb、wt、drat、gear 等。例如，我想按字母順序對它們進行排序。 這可能嗎？ ...

添加 Heatmaply 熱圖列的平均值作為其附近的注釋

[英]Add mean values of the columns of the Heatmaply heatmap as an anotation near it

如何添加 Heatmaply 熱圖列的平均值作為其附近的注釋？ 目前，作為一種不理想的方法，我運行它並得到下圖： 然而，這並不理想。 我希望將平均值作為另一個獨立列添加到熱圖中，我也可以在其中顯示值。 另外，我需要頂部的列標簽，我在這里問： 我計划在一個閃亮的應用程序中使用這個熱圖。 ...

heatmaply + flexdashboard = validateCssUnit(sizeInfo$width) 中的錯誤：CSS 單位必須是單元素數字或字符向量

[英]heatmaply + flexdashboard = Error in validateCssUnit(sizeInfo$width) : CSS units must be a single-element numeric or character vector

我看到了這個問題（2018）： R 閃亮錯誤：html 工具中的錯誤::validateCssUnit(height); CSS 單位必須是單元素數字或字符向量 估計是有關系的…… Heatmaply 是版本：1.1.1 flexdashboard 是版本：0.5.2 ...

R - 對二維直方圖/密度使用熱圖

[英]R - using heatmaply for a 2d histogram / density

我對編程和網站很陌生，所以如果我搞砸了這個解釋，請告訴我。 我有一系列相當長的 x, y 坐標表示二維空間中的一個字符。 假設空間是 200 x 400。我想通過一個漂亮的葉綠體來表示角色在每個 x、y 坐標中的時間量。 我想為此使用熱圖，因為我認為輸出很漂亮，而且我希望我的觀眾能夠放大數據。 ...

R：Heatmaply 在查看器中創建空白/空白區域

[英]R: Heatmaply creates empty/ white space in viewer

我試圖用我自己的數據創建一個熱圖，並且只得到空白。 我發現了這個關於如何根據 mtcars 數據進行熱圖工作的非常基本的說明。 重新啟動 R （關閉 Window 並重新打開，而不是內置重新啟動）后，我嘗試並仍然只收到空白。 關於如何解決這個問題的任何想法？ 提前致謝！ ...

在 pheatmap 中使用 heatmaply 樹狀圖排序

[英]Using heatmaply dendrogram sorting in pheatmap

有沒有辦法使用熱圖pheatmap heatmaply的熱圖？ 基本上與這里所問的相反： Clustering in pheatmap and heatmaply R packages 當我使用heatmaply而不是pheatmap時，我通常會看到更好的數據聚類。 但是，我並不總是想使用交互式 p ...

pheatmap 和 heatmaply R 包中的聚類

[英]Clustering in pheatmap and heatmaply R packages

我正在使用 R heatmaply package 來生成交互式熱圖。 我喜歡這個軟件，但我想從中獲得與使用 pheatmap package 相同的聚類（行和列的排序）。 因此，我希望這兩個命令產生相同的輸出： 有沒有辦法做到這一點？ 提前致謝。 阿圖羅 PS I recently asked a ...

R 熱圖和熱圖 output

[英]R heatmaply and pheatmap output

我正在使用 R heatmaply package 來生成交互式熱圖。 我喜歡這個軟件，但我想從中獲得與使用pheatmap package 相同的顏色 output。 因此，我希望這兩個命令產生相同的輸出： 有沒有辦法做到這一點？ 提前致謝。 阿圖羅 ...

使用 heatmaply 創建帶有原始值/數據而不進行轉換的熱圖？

[英]Use heatmaply to create heatmap with raw values/data without transformations?

使用heatmaply::heatmaply()創建熱圖時，會對原始數據執行一些轉換。 這在以下示例中很明顯，其中提供了一些 iris 數據集，但將鼠標懸停在熱圖上會顯示一些負值（這些值不在提供給heatmaply()的原始數據中），並且側面的顏色欄也顯示為負價值觀也是如此。 https://i ...

將集群關聯到熱圖

[英]Association Clusters to Heatmap

我有兩個單獨的數據框，其中一個我已經從第一個 dataframe 創建了一個熱圖，但是我想添加一個側邊欄，指示基因實際上與之相關的家族類型。 Dataframe 1 數據框2 熱圖創建： 我正在尋找這樣的東西，其中每種顏色代表一種與特定基因 class 相關的基因簇： ...

heatmaply：調整顏色

[英]heatmaply: adjust the colour

我正在使用heatmaply來可視化單細胞表達數據。 我想使用自定義顏色並將“黃色”分配給表達式級別> 2，將“洋紅色”分配給表達式級別<-2。 [-2,2]之間的范圍應該用“洋紅色”-“黑色”-“黃色”的平滑漸變來表示。 在這里，我的示例文件是一個 10 行 x 5 列的矩陣： 它產 ...