在 Jupyter Notebook 中調整散景圖大小

Question

我正在使用散景在 Jupyter Notebook 中繪圖，但我找不到使繪圖更大的方法。 我懷疑它應該很簡單，但我還找不到辦法做到這一點。

我的代碼是（我用它來繪制動態系統）：

import numpy as np
import scipy.integrate

import biocircuits

import bokeh.io
import bokeh.plotting
from bokeh.plotting import figure

import panel as pn
pn.extension()

bokeh.io.output_notebook()

def dX_dt(X, Y, mu):
    return Y * ( mu - 2*X )


def dY_dt(X, Y, mu):
    return -mu*X + X**2 - Y**2 + 1

def ode_rhs(x, t, mu):
    """Compute right-hand-side of pair of ODEs."""
    X, Y = x
    return np.array(
        [
            dX_dt(X, Y, mu),
            dY_dt(X, Y, mu),
        ]
    )

# Specify parameters
mu = 3.0


# Package for the integrating function
params_X = (mu,)
params_Y = (mu,)

# Plotting the phase portrait
X_range = [-3, 3]
Y_range = [-3, 3]

p = figure(plot_height=1000, plot_width=1000)

p = biocircuits.phase_portrait(
    dX_dt,
    dY_dt,
    X_range,
    Y_range,
    params_X,
    params_Y,
    x_axis_label="X",
    y_axis_label="Y",
    color="#e6ab02",
    plot_width=1000,
    height=1000
)

if mu < 2:
  p.circle(*np.array([ mu/2 , np.sqrt(1 - (mu/2)**2) ]), color='black', size=10)
  p.circle(*np.array([ mu/2 , -np.sqrt(1 - (mu/2)**2) ]), color='white', line_color='black', line_width=2, size=10)

if mu > 2:
  p.circle(*np.array([ mu/2 + np.sqrt((mu/2)**2 - 1), 0 ]), color='black', size=10)
  p.circle(*np.array([ mu/2 - np.sqrt((mu/2)**2 - 1), 0 ]), color='white', line_color='black', line_width=2, size=10)

p.title.text = "Kd = 1, β₀ = 1"
bokeh.io.show(p)

Answer 1

如果有人感興趣，我使用在調用函數之前定義散景圖形類型來解決它，然后將其傳遞給biocircuits.phase_portrait函數：

p = figure(plot_height=550, plot_width=700, x_axis_label="X", y_axis_label="Y",
           title="μ = 3")

p = biocircuits.phase_portrait(
    dX_dt,
    dY_dt,
    X_range,
    Y_range,
    params_X,
    params_Y,
    x_axis_label="X",
    y_axis_label="Y",
    color="#e6ab02",
    p=p
)

這有效！