如何使用 R reticulate 安裝 gekko package？

Question

我無法通過 R 網狀安裝 gekko package。 我的 R 版本是 3.4.4，我的 Python 版本是 3.8.8，我在 Python 中使用 Gekko 沒有問題。 所以我嘗試以我知道的這兩種方式在 R 上安裝：

1. py_install("gekko")

2. reticulate::conda_install("my_conda_environment", "gekko")

但是，在這兩種情況下，我都會在下面收到相同的錯誤。

PackagesNotFoundError：當前頻道不提供以下軟件包：

• 壁虎

當前頻道：

• https://conda.anaconda.org/root/win-64
• https://conda.anaconda.org/root/noarch
• https://repo.anaconda.com/pkgs/main/win-64
• https://repo.anaconda.com/pkgs/main/noarch
• https://repo.anaconda.com/pkgs/r/win-64
• https://repo.anaconda.com/pkgs/r/noarch
• https://repo.anaconda.com/pkgs/msys2/win-64
• https://repo.anaconda.com/pkgs/msys2/noarch

我沒有在 Anaconda 文檔中找到其他替代品。 我怎樣才能解決這個問題？

編輯：我根據 John Hedengren's answer and reticulate docs中的參考資料解決了我的問題。 為此，我需要創建一個新環境來指定 Python 版本和包，使用 R 中的以下代碼：

reticulate::py_install(
    packages = c(
        "numpy",  
        "pandas", # Or another packages that you need
        "gekko"
    ),
    envname  = "r-gekko",
    method = "conda", # On Windows, the 'conda' method is always used
    python_version = "3.8.8",
    pip = TRUE # It's mandatory to install gekko
)

Answer 1

Gekko 可從 pypi.org 獲得，帶有pip install gekko並且不適用於帶有 conda conda install gekko gekko 的 conda package 管理器。 以下是有關 如何使用pip安裝 Python 軟件包的更多信息。 您可能已經知道這一點，因為您在 Python 中使用了gekko ，但我已將其包含在此處以供其他人需要時使用。

兩個潛在的問題是：

• 安裝了多個 Python 版本，而與gekko一起使用的版本未安裝 gekko。
• Reticulate 不使用 PyPi 存儲庫來安裝gekko 。 以下是有關管理源（Conda 或 PyPi）以檢索包的附加信息。

我不熟悉 R 但還有其他人有類似的問題，例如：

• 使用 reticulate 和 Anaconda3 在 R 中從 PyPi 安裝 package 時出錯
• reticulate conda_install 無法從 PyPI 安裝 package
• 通過網狀在 R 中安裝 Python 模塊時出錯
• 如何在 conda 中安裝 anaconda 中不可用的包

Answer 2

遵循更一般的答案，以尋求類似情況的幫助：

1. 在 R 的新環境中安裝 gekko 和其他軟件包。

reticulate::py_install(
    packages = c(
        "gekko",
        "other_package==x.x.x", # It's possible to specify the package version 
        ... 
    ),
    envname = "new_env",
    method = "conda", # For Windows
    python_version = "3.x.x",
    pip = TRUE
)

2. 使用新環境調用 reticulate package。

Sys.setenv(RETICULATE_PYTHON = "/Users/user_name/anaconda#/envs/new_env/python.exe")
library(reticulate)

3. 在 R 中使用 gekko 運行 Python 腳本。

source_python("path/script.py")