從數據標簽中散布 Plot 二進制數據顏色編碼點

Question

I'd like to use matplotlib.pyplot.scatter to create a scatter plot similar to the picture below from data in a dataframe with a header that is formatted similar to the table here where all the points for a given sample are colored based on the label 在數據的第一列中，僅針對值為 1 的每個基因繪制一個點 - 對於值為 0 的基因沒有點：

label	基因a	b基因	基因 c	基因d
1	0	1	0	0
0	1	1	0	1
0	0	0	1	0
1	0	0	0	0
1	0	1	0	0

注意：我的樣本數據與我的樣本散點圖 plot output 不匹配。

Answer 1

將 dataframe 融化為長格式后，您可以使用 seaborn 的sns.relplot繪制矩陣

import pandas as pd
import seaborn as sns
sns.set_style("ticks")

df = pd.read_html('https://stackoverflow.com/q/70856944/14277722')[0]
df['sample'] = df.index
df = df.melt(['label','sample'])

g = sns.relplot(
    data=df,
    x="variable", y="sample", hue="label", size="value",
    hue_norm=(-1, 1), palette='tab10',
    height=6, sizes=(10, 300), size_norm=(0, 1)
)
g.set(xlabel="Genes", ylabel="Samples");