[英]How to assign and match land cover type from Corine to a dataframe with a set of lon lat coordinates?
我試圖找出一組坐標的土地利用類型,這些坐標定義了歐洲植物物種的位置。 但是,我被困在將土地使用分配給各個坐標的過程中。 任何建議都將受到歡迎!
首先,我從這里下載土地利用柵格文件: https ://land.copernicus.eu/pan-european/corine-land-cover
#Read raster file (year 2006 but could be any)
clc <- raster("U2006_CLC2000_V2020_20u1.tif")
然后,我閱讀了 Corine 土地利用類並用這些類重命名了光柵文件的級別
#Read Corine classes
clc_classes <- foreign::read.dbf("CLC_1990/DATA/U2006_CLC2000_V2020_20u1.tif.vat.dbf",
as.is = TRUE) %>%dplyr::select(value = Value,landcov = LABEL3)
這是我的完整坐標列表中的一小部分坐標(總共超過 200.000):
lon <- c("51.105", "51.195", "51.188", "51.239")
lat <- c("4.392", "4.395", "4.896", "4.468")
sp <- c("sp1","sp2", "sp3","sp4")
#Create minimal dataframe
d <- data.frame(lon,lat,sp)
但是現在我真的不知道如何繼續並創建具有土地利用類型的最終數據框,因為它與柵格文件匹配
我的意圖是在我的坐標與柵格文件的土地利用類型匹配后添加如下第 4 列。
#Example of how this fourth column would be like:
d$land_use <- c("Olive groves", "Olive groves", "Vineyards", "Pastures")
數據(來自同一網站的另一個文件)。
library(terra)
r <- rast("U2018_CLC2018_V2020_20u1.tif")
如您所見, r
知道類標簽。
r
#class : SpatRaster
#dimensions : 46000, 65000, 1 (nrow, ncol, nlyr)
#resolution : 100, 100 (x, y)
#extent : 9e+05, 7400000, 9e+05, 5500000 (xmin, xmax, ymin, ymax)
#coord. ref. : ETRS_1989_LAEA (EPSG:3035)
#source : U2018_CLC2018_V2020_20u1.tif
#color table : 1
#categories : LABEL3, Red, Green, Blue, CODE_18
#name : LABEL3
#min value : Continuous urban fabric
#max value : NODATA
head(cats(r)[[1]])
# Value LABEL3 Red Green Blue CODE_18
#1 1 Continuous urban fabric 0.9019608 0.0000000 0.3019608 111
#2 2 Discontinuous urban fabric 1.0000000 0.0000000 0.0000000 112
#3 3 Industrial or commercial units 0.8000000 0.3019608 0.9490196 121
#4 4 Road and rail networks and associated land 0.8000000 0.0000000 0.0000000 122
#5 5 Port areas 0.9019608 0.8000000 0.8000000 123
#6 6 Airports 0.9019608 0.8000000 0.9019608 124
以下是一些與extract
一起使用的示例點
pts <- matrix(c(3819069, 3777007, 3775822, 2267450, 2302403, 2331431), ncol=2)
extract(r, pts)
# LABEL3
#1 Sea and ocean
#2 Complex cultivation patterns
#3 Natural grasslands
或者使用您的 lon/lat 點(您的名稱顛倒了!),首先將它們轉換為土地利用柵格的坐標參考系統:
lat <- c(51.105, 51.195, 51.188, 51.239)
lon <- c(4.392, 4.395, 4.896, 4.468)
xy <- cbind(lon, lat)
v <- vect(xy, crs="+proj=longlat")
vv <- project(v, crs(r))
extract(r, vv)
# ID LABEL3
#1 1 Complex cultivation patterns
#2 2 Road and rail networks and associated land
#3 3 Pastures
#4 4 Industrial or commercial units
如果您想要土地使用代碼
activeCat(r) <- "CODE_18"
extract(r, vv)
# ID CODE_18
#1 1 242
#2 2 122
#3 3 231
#4 4 121
羅伯特的回答真的很棒,可以幫助像我這樣沒有線索的人。 然而,當我嘗試達到同樣的效果時,我得到了意想不到的結果。
當我跑
library(terra)
data <- rast("2018_CLC2018_V2020_20u1.tif")
data
我沒有標簽:
class : SpatRaster
dimensions : 46000, 65000, 1 (nrow, ncol, nlyr)
resolution : 100, 100 (x, y)
extent : 9e+05, 7400000, 9e+05, 5500000 (xmin, xmax, ymin, ymax)
coord. ref. : ETRS_1989_LAEA (EPSG:3035)
source : U2018_CLC2018_V2020_20u1.tif
name : U2018_CLC2018_V2020_20u1
min value : 1
max value : 48
因此,提取的結果在 1 - 48 范圍內。 這是我在網站上找到的唯一與命名匹配的文件。 很抱歉將此添加為答案,但我無法發表評論。
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