CRAN 包對生物導體包的依賴

Question

gRbase、gRain 和 gRim 包（我維護的）都使用 Bioconductor 上的 RBGL、graph 和 Rgraphviz 包的功能。 這意味着用戶不能直接安裝我的包（必須執行 setRepositories -> BioC 軟件）。 這當然不是世界上最大的問題，但它是一個大到給人們帶來麻煩或讓一些人放棄使用我的包的問題。

我的問題是：是否有任何說明，例如在 DESCRIPTION 中，必須從 Bioconductor 安裝 RBGL、graph 和 Rgraphviz，這樣我的軟件包的用戶就不會遇到這個麻煩？ 如果有辦法解決這個問題，那就太好了。

最好的問候索倫

Answer 1

您可以在DESCRIPTION文件中添加一行biocViews: 。 在這種情況下，它還會檢查 Bioconductor 是否存在 package 依賴項並從那里安裝它們。