R XML包中的htmlParse（）段錯誤：'內存未映射'

Question

我正在使用R 2.11.1和XML包3.1-0，當我遇到段錯誤時，我正在瀏覽R2GoogleMaps的示例。

#library(RJSONIO)
library(R2GoogleMaps)
library(XML)
#library(RCurl)

load("b.rda") # find in the sampleDocs folder in source file of R2GoogleMaps

center = c(mean(range(b$lat)), mean(range(b$long)))
code = addOverlay(gpolyline(b))

d = googleMapsDoc(code, center, zoom = 11, dim = c(750, 700), file = "simplePolyline.html")

下面是一個容易重現的代碼，它得到了同樣的錯誤：

> library(XML)
> a <- htmlParse("http://bm2.genes.nig.ac.jp/RGM2/R_current/library/XML/man/xmlTreeParse.html")
> a

 *** caught segfault ***
address 0x55aa44, cause 'memory not mapped'

Traceback:
 1: .Call("RS_XML_dumpHTMLDoc", doc, as.integer(indent), as.character(encoding),     as.logical(indent), PACKAGE = "XML")
 2: saveXML(from)
 3: saveXML(from)
 4: asMethod(object)
 5: as(x, "character")
 6: cat(as(x, "character"), "\n")
 7: print.XMLInternalDocument(<pointer: 0x1016363f0>)
 8: print(<pointer: 0x1016363f0>)

Possible actions:
1: abort (with core dump, if enabled)
2: normal R exit
3: exit R without saving workspace
4: exit R saving workspace
Selection: 1
aborting ...

Process R segmentation fault at Sat Jul 31 22:07:02 2010

這個問題似乎也做了saveXML()在htmlParse()文件。

當我寫另一個使用htmlParse()代碼時，我不記得遇到過這個問題（雖然我不記得我是否明確調用了htmlParse()對象）。 所以我不完全確定這是否是最近的問題。 當時和現在（我記得）的唯一區別是我從源代碼安裝了許多OmegaHat軟件包 。

我很好奇，如果有其他人得到這個錯誤。 為了探究我的筆記本電腦是否存在原因，我已經重新啟動並升級了我的操作系統作為基本步驟。 可能是什么問題？ 謝謝。

編輯 ：僅供參考：

> sessionInfo()
R version 2.11.1 (2010-05-31) 
x86_64-apple-darwin9.8.0 

locale:
[1] C

attached base packages:
[1] stats     graphics  grDevices utils     datasets  grid      methods  
[8] base     

other attached packages:
[1] XML_3.1-0     digest_0.4.2  reshape_0.8.3 plyr_0.1.9    proto_0.3-8  

loaded via a namespace (and not attached):
[1] ggplot2_0.8.7

Answer 1

我認為，幾乎按照定義，分段錯誤構成了一個錯誤。 你的例子對我有用（見下文）。

我會（a）確保你有最新版本的XML，並且錯誤仍然存​​在; （b）聯系XML包的維護者（試試

維護者（“XML”））並提供您的示例和sessionInfo（）的結果

祝好運。

=============

library（XML）a < - htmlParse（“ http://bm2.genes.nig.ac.jp/RGM2/R_current/library/XML/man/xmlTreeParse.html ”）

sessionInfo（）R版本2.11.1（2010-05-31）i486-pc-linux-gnu

locale：[1] LC_CTYPE = en_US.UTF-8 LC_NUMERIC = C.
[3] LC_TIME = en_US.UTF-8 LC_COLLATE = en_US.UTF-8
[5] LC_MONETARY = C LC_MESSAGES = en_US.UTF-8
[7] LC_PAPER = en_US.UTF-8 LC_NAME = C.
[9] LC_ADDRESS = C LC_TELEPHONE = C.
[11] LC_MEASUREMENT = en_US.UTF-8 LC_IDENTIFICATION = C.

附加基礎包：[1] stats graphics grDevices utils數據集網格方法
[8]基地

其他附件包：[1] XML_3.1-0 reshape_0.8.3 plyr_1.0.3 proto_0.3-8

通過命名空間加載（而不是附加）：[1] ggplot2_0.8.8