我應該如何為R和Octave方法（可能使用Python）進行快速GUI開發？

Question

我們是一個中型學術研究實驗室，其主要輸出是用於分析大型數據集的新統計方法。 我們通常用R和MATLAB / Octave開發。

我們希望通過構建簡單的向導式用戶界面來擴展我們工作的范圍，以訪問我們的方法，如RNAfold等網絡應用程序或分析私有數據的獨立應用程序。

理想情況下，我們希望接口進行一些數據檢查，僅使用FOSS，在Mac和Windows環境中運行，並能夠生成簡單的圖表和圖形，可以作為適合發布的數字輸出。 此外，我們喜歡Python，因為它是實驗室和我們研究社區的流行語言。

但是，我們希望能夠快速，廉價地開發和發布。 我們很幸運能夠為實驗室中的一位開發人員提供資金，並且他/她必須支持多個項目。

有很多團體與我們有着相同的需求和約束，因此能夠為這類挑戰制定一致的長期戰略是有用的。

編輯我要求就四種可能的方法提出意見，包括以下評論摘要：

1. 從Python調用R和Octave方法。
   回答：
   • R / Python集成
     • Rpy （來自ChrisC ）
     • pyRserve （來自radek ）
     • PypeR （來自radek ，見論文鏈接的答案）
   • 使用Python客戶端調用Octave服務器（來自ChrisC ）
2. 在Python中重新實現我們的方法。 通常，這並不容易，因為我們的方法依賴於在R和Octave中實現的其他方法。 回答：
   • 沒有評論這種方法，這可能是一個壞主意。
3. 使用不同的框架來構建用戶界面。
   回答：
   • 如何直接在R中構建GUI和Web應用程序？ （來自hadley ，見工具參考答案）
4. 我們尚未考慮的其他想法，例如與Taverna等工作流管理系統集成。
   回答：
   • 嘗試像RedR這樣的可視化編程界面（來自chrisamiller ）

我的首選答案

我首先要研究Spacedman建議的方法：使用QtDesigner為PyQt4構建UI並使用RPy調用R. 我們讓很多沒有編程背景的學生想要在實驗室做志願者，而QtDesigner看起來像我們可以訓練他們有效使用的東西。

我想直接在R開發GUI，如hadley推薦但是RQt ，我認為我需要使用QtDesigner，似乎沒有積極開發（最后更新是2009年夏天）。

此外，看起來我們可能必須在R中專門開始實現我們的方法，並從MATLAB / Octave轉換為R.在我的領域，無論如何這可能不是一個壞主意。

附錄：

1. 用於簡化用戶界面構建的Python庫：
   • wxPython （ ChrisC ）
   • PyQt4 （來自Spacedman ）
2. 集成Python，R和Octave的其他項目：
   • SAGE （ Dirk Eddelbuettel ）
   • 幕府將軍 （ Dirk Eddelbuettel ）
3. 用於制作GUI的GUI：
   • QtDesigner與PyQt4 （來自Spacedman ）。 注意Qt4既是商業版，也是LGPL版。

Answer 1

為什么不繼續直接在R？ 有許多軟件包允許您開發GUI（gWidgets RGtk，tcl / tk，RQt，Rwxwidgets，rjava）或Web應用程序 。

Answer 2

我將使用Python和PyQt4作為UI，並使用Rpy與R接口。

有用於界面設計的QtDesigner，你可以從中生成python。 QtAssistant為Qt提供了一個完全超鏈接的文檔集，這是我用過的最好的。

非常值得！

Answer 3

這是一個很高的訂單 - 多平台，多后端（R和Ocatve），以及便宜，快速和易於使用！

從頭頂看，看看這些

• Sage ：他們擁有他們稱之為筆記本電腦的互動網頁，並在useR上展示了一個不錯的演示！ 2010; 我認為Octave也被覆蓋了

• Shogun ：它還集成了Python，R和Octave，並且可能有一些工具供您利用。

Answer 4

我一直在尋找類似的東西 - 在R中簡單快速的GUI。似乎有一個來自RStudio家伙的新選擇。

對於沒有太多編碼的小型Web界面， Shiny應該足夠了。 如果您需要簡單的輸入/輸出樣式的UI，它似乎是一個可行的選項。

Answer 5

我沒有嘗試直接連接Octave和Python，除了將Octave應用程序設置為服務器並調用Python客戶端之外，但我有幸運行將R與Python禮貌RPy集成。 在我們的一些應用程序中，我們構建了一個例如wxPython + matplotlib Python前端，並直接通過RPy調用R腳本。

Answer 6

對於R和Python集成，您可能還需要查看

• pyRserve
• PypeR [ 論文更多內容]

Answer 7

您可以嘗試查看RedR ，它允許您將R包封裝在Python GUI中。