我应该如何为R和Octave方法（可能使用Python）进行快速GUI开发？

Question

我们是一个中型学术研究实验室，其主要输出是用于分析大型数据集的新统计方法。 我们通常用R和MATLAB / Octave开发。

我们希望通过构建简单的向导式用户界面来扩展我们工作的范围，以访问我们的方法，如RNAfold等网络应用程序或分析私有数据的独立应用程序。

理想情况下，我们希望接口进行一些数据检查，仅使用FOSS，在Mac和Windows环境中运行，并能够生成简单的图表和图形，可以作为适合发布的数字输出。 此外，我们喜欢Python，因为它是实验室和我们研究社区的流行语言。

但是，我们希望能够快速，廉价地开发和发布。 我们很幸运能够为实验室中的一位开发人员提供资金，并且他/她必须支持多个项目。

有很多团体与我们有着相同的需求和约束，因此能够为这类挑战制定一致的长期战略是有用的。

编辑我要求就四种可能的方法提出意见，包括以下评论摘要：

1. 从Python调用R和Octave方法。
   回答：
   • R / Python集成
     • Rpy （来自ChrisC ）
     • pyRserve （来自radek ）
     • PypeR （来自radek ，见论文链接的答案）
   • 使用Python客户端调用Octave服务器（来自ChrisC ）
2. 在Python中重新实现我们的方法。 通常，这并不容易，因为我们的方法依赖于在R和Octave中实现的其他方法。 回答：
   • 没有评论这种方法，这可能是一个坏主意。
3. 使用不同的框架来构建用户界面。
   回答：
   • 如何直接在R中构建GUI和Web应用程序？ （来自hadley ，见工具参考答案）
4. 我们尚未考虑的其他想法，例如与Taverna等工作流管理系统集成。
   回答：
   • 尝试像RedR这样的可视化编程界面（来自chrisamiller ）

我的首选答案

我首先要研究Spacedman建议的方法：使用QtDesigner为PyQt4构建UI并使用RPy调用R. 我们让很多没有编程背景的学生想要在实验室做志愿者，而QtDesigner看起来像我们可以训练他们有效使用的东西。

我想直接在R开发GUI，如hadley推荐但是RQt ，我认为我需要使用QtDesigner，似乎没有积极开发（最后更新是2009年夏天）。

此外，看起来我们可能必须在R中专门开始实现我们的方法，并从MATLAB / Octave转换为R.在我的领域，无论如何这可能不是一个坏主意。

附录：

1. 用于简化用户界面构建的Python库：
   • wxPython （ ChrisC ）
   • PyQt4 （来自Spacedman ）
2. 集成Python，R和Octave的其他项目：
   • SAGE （ Dirk Eddelbuettel ）
   • 幕府将军 （ Dirk Eddelbuettel ）
3. 用于制作GUI的GUI：
   • QtDesigner与PyQt4 （来自Spacedman ）。 注意Qt4既是商业版，也是LGPL版。

Answer 1

为什么不继续直接在R？ 有许多软件包允许您开发GUI（gWidgets RGtk，tcl / tk，RQt，Rwxwidgets，rjava）或Web应用程序 。

Answer 2

我将使用Python和PyQt4作为UI，并使用Rpy与R接口。

有用于界面设计的QtDesigner，你可以从中生成python。 QtAssistant为Qt提供了一个完全超链接的文档集，这是我用过的最好的。

非常值得！

Answer 3

这是一个很高的订单 - 多平台，多后端（R和Ocatve），以及便宜，快速和易于使用！

从头顶看，看看这些

• Sage ：他们拥有他们称之为笔记本电脑的互动网页，并在useR上展示了一个不错的演示！ 2010; 我认为Octave也被覆盖了

• Shogun ：它还集成了Python，R和Octave，并且可能有一些工具供您利用。

Answer 4

我一直在寻找类似的东西 - 在R中简单快速的GUI。似乎有一个来自RStudio家伙的新选择。

对于没有太多编码的小型Web界面， Shiny应该足够了。 如果您需要简单的输入/输出样式的UI，它似乎是一个可行的选项。

Answer 5

我没有尝试直接连接Octave和Python，除了将Octave应用程序设置为服务器并调用Python客户端之外，但我有幸运行将R与Python礼貌RPy集成。 在我们的一些应用程序中，我们构建了一个例如wxPython + matplotlib Python前端，并直接通过RPy调用R脚本。

Answer 6

对于R和Python集成，您可能还需要查看

• pyRserve
• PypeR [ 论文更多内容]

Answer 7

您可以尝试查看RedR ，它允许您将R包封装在Python GUI中。