將RMySQL包添加到R失敗（在Windows上）？

Question

我無法弄清楚為什么我的RMySQL包不能安裝 - 這就是我得到的：

> install.packages('RMySQL',type='source')
trying URL 'http://cran.mirrors.hoobly.com/src/contrib/RMySQL_0.7-5.tar.gz'
Content type 'application/x-gzip' length 160769 bytes (157 Kb)
opened URL
downloaded 157 Kb

* installing *source* package 'RMySQL' ...
ERROR: configuration failed for package 'RMySQL'
* removing 'C:/PROGRA~1/R/R-212~1.0/library/RMySQL'

The downloaded packages are in '(foo)'

Warning message:
In install.packages("RMySQL", type = "source") : installation of package 'RMySQL' had    non-zero exit status

我不認為這是MySQL安裝的問題，因為正確的值似乎在注冊表中：

> Sys.getenv('MYSQL_HOME')
                 MYSQL_HOME "C:/PROGRA~1/MySQL/MYSQLS~1.1/" 
> readRegistry("SOFTWARE\\MySQL AB", hive="HLM", maxdepth=2)
$`MySQL Server 5.1`
$`MySQL Server 5.1`$DataLocation
[1] "C:\\Documents and Settings\\All Users\\Application Data\\MySQL\\MySQL Server 5.1\\"

$`MySQL Server 5.1`$FoundExistingDataDir 
[1] "0"

$`MySQL Server 5.1`$Location 
[1] "C:\\Program Files\\MySQL\\MySQL Server 5.1\\"

$`MySQL Server 5.1`$Version
[1] "5.1.54"

困惑。 任何幫助將不勝感激！

Answer 1

這里描述了基本過程，但有幾個提示，所以我將描述整個解決方案（如果需要，請更改R版本和路徑） ：

1. 從這里安裝最新的RTools
2. 安裝MySQL或mysql的頭文件和庫文件
3. 創建或編輯文件C:\\Program Files\\R\\R-2.12.1\\etc\\Renviron.site並添加如MYSQL_HOME=C:/mysql （mysql文件的路徑）
4. 將libmysql.lib從mysql / lib復制到mysql / lib / opt以滿足依賴關系。
5. 將libmysql.dll復制到C:\\Program Files\\R\\R-2.12.1\\bin或windows/system32目錄。
6. 運行install.packages('RMySQL',type='source')並等待編譯結束。

這在Windows 7 64位上對我有用，因此32位版本應該沒有問題

最初發布在這里 （類似的問題）。

Answer 2

首先，我會嘗試按照此頁面上的說明進行操作： http ： //biostat.mc.vanderbilt.edu/wiki/Main/RMySQL

然后，確保您的計算機上確實有一個MySQL客戶端，而不僅僅是服務器本身。 我自己有一個問題，我不得不為客戶端使用舊的二進制文件，但你可以從mysql網站下載這些。

Answer 3

我創建了一個可能適用於人們的二進制文件：

http://kenahoo.blogspot.com/2011/09/rmysql-binary-for-windows-7.html

我基本上遵循了所有這些方向，包括Vanderbilt頁面上的方向，但出於某種原因，它似乎並不總是有效。 無論如何，希望這可能對我使用相同版本的東西的人有所幫助。

Answer 4

我偶然發現了在Windows7 64bit下安裝RMySQL的分步指南。

http://www.ahschulz.de/2013/07/23/installing-rmysql-under-windows/

我使用的軟件是：

1. Windows 8操作系統
2. R3.0.2 - 64位
3. Rtools 3.1
4. MySQL服務器社區版5.6 - 64位

按照上面的指南（提供截圖），我的安裝和加載RMySQL包工作。

非常感謝Arne Hendrik Schulz！

Answer 5

我在使用R 2.12.1 x64的Windows 7上遇到同樣的問題並通過以下方式解決：

1. 將PATH變量中的R目錄更改為C:\\Program Files\\R\\R-2.12.1\\bin\\x64 （而不僅僅是...\\R-2.12.1\\bin ）。
2. 將...\\MySQL Server 5.5\\lib\\libmysql.dll復制到...\\MySQL Server 5.5\\bin\\ 。
3. 在cmd.exe中運行R CMD INSTALL RMySQL_0.7-5.tar.gz （ R CMD INSTALL RMySQL_0.7-5.tar.gz中的install.packages('RMySQL',type='source')仍然無效）。

Answer 6

我在使用RMySQL包安裝R的最后2天工作，最后得到了解決方案，這里是安裝RMySQL包的步驟： -

1. 從以下鏈接下載軟件：* a。 R2.13.2：從http://cran.stat.sfu.ca/index.html下載R.

     b. RTools 214: Download RTools from http://cran.cict.fr c. RMySQL 0.8-0.tar.gz: Download RMySQL from http://biostat.mc.vanderbilt.edu/wiki/main/RMySQL/RMySQL_0.8-0.tar.gz d. MySQL Server 5.0: download it from http://dev.mysql.com e. RSTUDIO (optional): download it from http://rstudio.org* 

2. 設置以下環境變量

     * a. MYSQL_HOME : <drive>/path to MySQL installation folder eg MYSQL_HOME= C:\\Program Files\\MySQL\\MySQL Server 5.5\\ b. R_HOME: <drive>/path to R installation eg R_HOME=C:\\Program Files\\R\\R-2.13.2\\ c. PATH: Modify path to accommodate the above variables. * 

   確保Windows PATH變量包含以下路徑： \\ Rtools \\ 2.14 \\ bin \\ Rtools \\ 2.14 \\ MinGW \\ bin \\ Rtools \\ 2.14 \\ MinGW64 \\ bin

3. 創建文件夾和復制文件

   一個。 OPT：在C：\\ Program Files \\ MySQL \\ MySQL Server 5.5 \\ lib下創建一個文件夾OPT並復制
   MYSQLLIB.LIB上面的路徑。 同時將libmysql.dll復制到\\​​\\ R \\ R-2.14.0 \\ bin \\（64位）或\\\\ R \\ R-2.14.0 \\ bin \\ i386 \\（32位）和C：\\ Windows \\ System32。

灣 Renviron.site：創建或編輯文件\\\\ R \\ R-2.14.0 \\ etc \\ Renviron.site並添加一行：MYSQL_HOME =“C：/ Program Files / MySQL / MySQL Server 5.5 /”NB：USE FORWARD SLASH這里有雙重報價

C。 libMySQL.dll：將此文件復制到C：\\ Program Files \\ R \\ R-2.13.2 \\ bin \\ i386以及C：\\ Program Files \\ R \\ R-2.13.2 \\ bin

1. 運行命令

   一個。 Install.Packages：通過單擊桌面上的R圖標或從“開始”菜單運行R GUI。 輸入INSTALL.PACKAGES（“RMySQL”，type =“Sources”）。 這將從存儲庫下載所需的軟件。

灣 命令提示符：復制下載的zip文件（在步驟4.a.中）並將其粘貼到R安裝文件夾下。 轉到“開始”菜單並打開“命令提示符”。 轉到R安裝文件夾，然后鍵入R CMD INSTALL RMySQL_0.8-0.tar.gz

  *COMMANDS:
  >library(RMySQL)
   >drv = dbDriver("MySQL")
   >con = dbConnect(drv,host="localhost",dbname="test",user="root",pass="root")
   >album = dbGetQuery(con,statement="select * from t_master")
   >album*

Answer 7

18個月后，新筆記本電腦，同樣的問題。 回到犯罪現場 - 對不起2011年1月的自我; 我們將來，這個安裝仍然沒有任何樂趣。

得到教訓：

- 更新的RTools是必不可少的 。 得到他們 。

- 您是否看到.onLoad failed in loadNamespace() for 'RMySQL', details錯誤.onLoad failed in loadNamespace() for 'RMySQL', details ？ 這似乎意味着您的系統環境變量存在問題。

在R中，運行

Sys.getenv('MYSQL_HOME')

如果它吐出像這樣的路徑

 [1] "C:\\Program Files\\MySQL\\MySQL Server 5.6"

你很厲害。 但如果它給你空字符串，你需要設置它。

這些都是Windows 7的方向，但是如果內存服務，這個過程在XP中非常相似。

1）打開系統屬性>高級>環境變量。

2）在較低的“系統變量”窗格中，單擊“新建”。

3）變量名是MYSQL_HOME ，值是MySQL安裝的路徑 - 我的是C:\\Program Files\\MySQL\\MySQL Server 5.6

較新版本的MySQL似乎沒有在安裝時創建環境變量 - 而且缺少RMySQL的二進制文件解釋了為什么這個問題已經獲得了8,000次點擊。

- 還沒卡住？ 這里有兩個附加的深入writeups： 1 ， 2

Answer 8

以下為red hat linux工作

wget http://cran.r-project.org/src/contrib/RMySQL_0.9-3.tar.gz
sudo R CMD INSTALL  --configure-args='--with-mysql-inc=/usr/include/mysql' --configure-args='--with-mysql-lib=/usr/lib64/mysql' RMySQL_0.9-3.tar.gz

Answer 9

正如馬雷克所說。 此軟件包沒有Windows二進制文件。 當我嘗試安裝RPostgreSQL時，我在Mac上遇到了類似的麻煩（因為Mac沒有二進制文件），最后我必須自己編譯並修改幾個文件。

對於MySQL部分（如果你對MySQL不太了解），你可能想要使用WAMP ，這肯定比你需要的更多，但易於安裝和啟動和關閉。

對於某些編譯幫助，您可能對Rtools感興趣

HTH

BTW：你跑什么樣的窗戶（sry，如果我錯過的話）

Answer 10

然而，您目前還有一個額外的要求（使用MySQL服務器版本5.5和R2.12.1），請按照目前的http：//biostat.mc.vanderbilt.edu/wiki/Main/RMySQL說明作為libmySQL.dll的位置與包裝中的預期不同。

即64位編譯。 它希望libmySQL.dll位於“$ {MYSQL_HOME}”/ bin / libmySQL.dll中，所以只需將dll復制到/ bin目錄，它就會編譯。

對於32位的計算。 libmySQL.lib預計會在“$ {MYSQL_HOME}”/ lib / opt / libmysql.lib中再次移動，這應該可以解決問題。

或者，如果您不想或不能移動這些文件。 然后你可以編輯源代碼文件：Makevars.win Makevars.win32 Makevars.win64適當指向/lib/libmysql.dll /lib/libmysql.lib

Answer 11

將MySQL和RTools目錄添加到PATH！

這是我的路徑; ~blah~;C:\\Program Files\\MySQL\\MySQL Server 5.5\\bin;c:\\rtools\\bin;C:\\Rtools\\gcc-4.6.3\\bin; ; ~blah~;C:\\Program Files\\MySQL\\MySQL Server 5.5\\bin;c:\\rtools\\bin;C:\\Rtools\\gcc-4.6.3\\bin;