如何在服務器上設置共享R包目錄？

Question

我在服務器上有一個共享的R包目錄，以便為所有用戶維護一致的包版本。 當有人試圖安裝另一個用戶最初安裝的新版本的軟件包時，或者當該軟件包在其他地方加載時，他們會嘗試安裝它。 在這些實例中，R在共享包目錄中創建00LOCK-PackageName目錄，並且權限使得安裝程序不具有對目錄中的許多文件的寫訪問權。 然后，這需要幾個人chmod-ind目錄以允許它被刪除，或者讓我們的系統管理員做同樣的事情。

這是一個特別嚴重的問題，因為我們使用R包來維護和部署我們的報告基礎架構。 這是我們不斷更新和部署到我們的共享服務器的東西。

是否有促進共享R包管理的設置或程序？ 任何一般提示？

Answer 1

一個常見的解決方案是

• 讓每個人都成為一個共同團體的成員，mayne rapps

• 讓你共享R包的目錄由rapps擁有，並且你想讓它變成'粘性' - 如果我沒chmod g=rwt話， chmod g=rwt

• 將你的umask默認設置在/etc/profile或等效設置中，以確保你的默認創建模式實際上是'g + w'; 我用一個文件/etc/profile.d/local_umask.sh用一個命令umask u=rwx,g=rwx,o=rx

Answer 2

我們最終讓我們的系統管理員創建了一個腳本：

• 打開共享包目錄中所有目錄，子目錄和文件的權限
• 刪除任何以00LOCK開頭且超過15分鍾的目錄
• 每分鍾都跑

從那以后我們沒有遇到任何問題。