脫機安裝R軟件包和依賴項

Question

假設我需要在沒有Internet連接的（Linux）機器上安裝許多軟件包。 假設我下載了一份cran副本，並將其刻錄到DVD上，然后將其帶到離線位置：

wget ftp://cran.r-project.org/pub/R/src/contrib/*.tar.gz

我什至可以添加一個PACKAGES文件，其中包含所有源包及其依賴項的概述：

library(tools)
write_PACKAGES()

我如何使用此脫機方式安裝源程序包，從而也可以解決依賴關系並從本地文件安裝？ 例如，某人想要安裝軟件包ggplot2，它具有相當深的依賴性結構。 假設ggplot2的源包及其所有依賴項都可以在當前工作目錄中作為源包使用。 如果我做：

install.packages("ggplot2_0.9.1.tar.gz", repos=NULL)

這將導致錯誤，因為根本無法解決依賴關系。 或者：

install.packages(list.files(pattern="*.tar.gz"), repos=NULL)

但是，這也忽略了依賴關系結構，並嘗試按字母順序安裝軟件包，這也會失敗。

我研究了available.packages和contrib.url但是我找不到從本地文件（包括其依賴項）安裝源程序包的示例。

Answer 1

約書亞·烏爾里希（Joshua Ulrich）在對問題的評論中給出了正確答案：

關鍵是在repos或contriburl的參數前面加上file:// 。 因此，在Unixy系統中，可以做到：

install.packages("ggplot2", contriburl="file:///path/to/packages/")

假設所有必需的源軟件包以及PACKAGES索引文件都在/path/to/packages可用。 如果沒有PACKAGES文件，則應首先使用以下命令生成：

library(tools)
write_PACKAGES("/path/to/packages/")

這將生成在此目錄中找到的所有源包的索引。 請注意，在示例中， file:前綴后面有3個斜杠。 第三個斜杠表示相對於文件系統根目錄的路徑。

repos和contriburl參數之間的區別在於， repos會將另一個/src/contrib附加到指定的路徑，因為通常這是源程序包位於官方CRAN存儲庫鏡像上的位置。

Answer 2

參考上面的答案，如果安裝在Windows中，則write_PACKAGES（）會生成兩個文件：在/ zip / to / packages /目錄下的PACKAGES和PACKAGES.gz，其中放置了所有zip文件。 在install.packages（）函數能夠正確讀取單獨的PACKAGES文件之前，應刪除文件PACKAGES.gz，否則會出現“無法打開壓縮文件”錯誤。

Answer 3

在脫機安裝過程中，我遇到了同樣的問題。 不知何故，它無法通過命令行運行。

我下載並提取了所有依賴項（需要檢查最低版本），然后將文件夾粘貼到庫文件夾中。 這樣，只有我的問題得到了解決。