[英]read specific lines from a file using python
我有一個數據如下的文件:
1xxy
(1gmh)
[white line]
ahdkfkbbmhkkkkkyllllkkjdttyshhaggdtdyrrrutituy
[white line]
__________________________________________________
Intra Chain:
A 32
__________________________________________________
PAIR 1MNS HE 10 NM A ARG 33 OX1 3.22 32
PAIR 1MNS UR 11 NM A ARG 33 OX2 3.21 12
PAIR IMNS UK 32 NH A ASN 43 OZ1 5.21 22
...
__________________________________________________
現在我想使它像:
PAIR 1MNS HE 10 NM A ARG 33 OX1 3.22 32
PAIR 1MNS UR 11 NM A ARG 33 OX2 3.21 12
PAIR IMNS UK 32 NH A ASN 43 OZ1 5.21 22
...
即刪除所有其他字符。 我嘗試使用:
inp = open('c:/users/rox/desktop/1UMG.out','r')
for line in inp:
if not line.strip(): # to remove excess whit lines
continue
else:
z = line.strip().replace('\t',' ')
if z.startswith('PAIR'):
print z
inp.close()
但是這段代碼也沒有給我任何輸出。 無法弄清為什么z.startswith('PAIR')
無法正常工作。 但是到上一行為止,一切都很好。
看起來您只在看以PAIR
開頭的行,所以為什么不這樣簡單:
with open('data.txt') as infp:
for line in infp:
line = line.strip()
if line.startswith('PAIR'):
print(line)
會給:
PAIR 1MNS HE 10 NM A ARG 33 OX1 3.22 32
PAIR 1MNS UR 11 NM A ARG 33 OX2 3.21 12
PAIR IMNS UK 32 NH A ASN 43 OZ1 5.21 22
此輸出將刪除前3個空格,如果需要的話,將它們重新添加起來很簡單。
注意 :使用with
將在完成操作或遇到異常時自動為您關閉文件。
除了@Levon的解釋之外,由於文件對象支持迭代器協議,並且根據文件的大小,可以使用列表推導:
[l for l in open('test.txt') if l.startswith('PAIR')]
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