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使用python从文件读取特定行

[英]read specific lines from a file using python

我有一个数据如下的文件:

   1xxy
   (1gmh)

[white line]
ahdkfkbbmhkkkkkyllllkkjdttyshhaggdtdyrrrutituy
[white line]  
   __________________________________________________
   Intra Chain:
   A 32
   __________________________________________________
   PAIR 1MNS HE 10 NM A ARG 33 OX1 3.22 32
   PAIR 1MNS UR 11 NM A ARG 33 OX2 3.21 12
   PAIR IMNS UK 32 NH A ASN 43 OZ1 5.21 22
   ...
   __________________________________________________

现在我想使它像:

   PAIR 1MNS HE 10 NM A ARG 33 OX1 3.22 32
   PAIR 1MNS UR 11 NM A ARG 33 OX2 3.21 12
   PAIR IMNS UK 32 NH A ASN 43 OZ1 5.21 22
   ...

即删除所有其他字符。 我尝试使用:

inp = open('c:/users/rox/desktop/1UMG.out','r')
for line in inp:
    if not line.strip():      # to remove excess whit lines
       continue
    else:
       z = line.strip().replace('\t',' ')
       if z.startswith('PAIR'):
          print z
inp.close()

但是这段代码也没有给我任何输出。 无法弄清为什么z.startswith('PAIR')无法正常工作。 但是到上一行为止,一切都很好。

看起来您只在看以PAIR开头的行,所以为什么不这样简单:

with open('data.txt') as infp:
   for line in infp:
      line = line.strip()
      if line.startswith('PAIR'):
         print(line)

会给:

PAIR 1MNS HE 10 NM A ARG 33 OX1 3.22 32
PAIR 1MNS UR 11 NM A ARG 33 OX2 3.21 12
PAIR IMNS UK 32 NH A ASN 43 OZ1 5.21 22

此输出将删除前3个空格,如果需要的话,将它们重新添加起来很简单。

注意 :使用with将在完成操作或遇到异常时自动为您关闭文件。

除了@Levon的解释之外,由于文件对象支持迭代器协议,并且根据文件的大小,可以使用列表推导:

[l for l in open('test.txt') if l.startswith('PAIR')]

暂无
暂无

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