從列表清單制作字典

Question

我一直無法弄清楚，我認為問題可能出在我制作列表清單的方式上。 有人可以幫忙嗎？ 謝謝！

我想要的結果是

codondict = {'A'：['GCT'，'GCC'，'GCA'，'GCG']，'C'：['TGT'，'TGC']，＆c

但是我得到的是：

{'A'：'A'，'C'：'C'，＆c。

這是我的終端：

A = [ 'GCT'， 'GCC'， 'GCA'， 'GCG']

C = [ 'TGT'， 'TGC']

d = [ 'GAT'， 'GAC']

E = [ 'GAA'， 'GAG']

F = [ 'TTT'， 'TTC']

G = [ 'GGT'， 'GGC'， 'GGA'， 'GGG']

H = [ '貓'， 'CAC']

I = [ 'ATT'， 'ATC'， 'ATA']

K = [ 'AAA'， 'AAG']

L = [ 'TTA'， 'TTG'， 'CTT'， 'CTC'， 'CTA'， 'CTG']

M = [ 'ATG']

N = [ 'AAT'， 'AAC']

P = [ 'CCT'， 'CCC'， 'CCA'， 'CCG']

Q = [ 'CAA'， 'CAG']

R = [ 'CGT'， 'CGC'， 'CGA'， 'CGG'， 'AGA'， 'AGG']

S = [ 'TCT'， 'TCC'， 'TCA'， 'TCG'， 'AGT'， 'AGC']

T = [ 'ACT'， 'ACC'， 'ACA'， 'ACG']

V = [ 'GTT'， 'GTC'， 'GTA'， 'GTG']

W = [ 'TGG']

Y = [ 'TAT'， 'TAC']

氨基酸= [ 'A'， 'C'， 'd'， 'E'， 'F'， 'G'， 'H'， 'I'， 'K'， 'L'， 'M'， 'N' ， 'P'， 'Q'， 'R'， 'S'， 'T'， 'V'， 'W'， 'Y']

從集合導入defaultdict

codondict = defaultdict（列表）

對於我的氨基酸：

...對於i中的j：（也對list（i）中的j進行了嘗試）

... ... codondict [i] = j ...

codondict

defaultdict（，{'A'：'A'，'C'：'C'，'E'：'E'，'D'：'D'，'G'：'G'，'F'：'F '，'I'：'I'，'H'：'H'，'K'：'K'，'M'：'M'，'L'：'L'，'N'：'N'， 'Q'：'Q'，'P'：'P'，'S'：'S'，'R'：'R'，'T'：'T'，'W'：'W'，'V '：'V'，'Y'：'Y'}）

Answer 1

您可以嘗試以下方法：

condondict= dict(A=['GCT','GCC','GCA','GCG'],
C=['TGT','TGC'],
D=['GAT','GAC'],
E=['GAA','GAG'],
F=['TTT','TTC'],
G=['GGT','GGC','GGA','GGG'],
H=['CAT','CAC'],
I=['ATT','ATC','ATA'],
K=['AAA','AAG'],
L=['TTA','TTG','CTT','CTC','CTA','CTG'],
M=['ATG'],
N=['AAT','AAC'],
P=['CCT','CCC','CCA','CCG'],
Q=['CAA','CAG'],
R=['CGT','CGC','CGA','CGG','AGA','AGG'],
S=['TCT','TCC','TCA','TCG','AGT','AGC'],
T=['ACT','ACC','ACA','ACG'],
V=['GTT','GTC','GTA','GTG'],
W=['TGG'],
Y=['TAT','TAC'])

使用defaultdict()的原因是允許在不引起KeyError的情況下訪問/創建字典值，或者使用以下形式繞過：

if key not in mydict.keys():
    mydict[key] = []
mydict[key].append(something)

如果您不是動態創建新鍵，則實際上不需要使用defaultdict() 。

同樣，如果您的密鑰已經代表了氨基酸 ，那么您就可以迭代密鑰本身。

for aminoacid, sequence in condondict.iteritems():
    # do stuff with with data...

Answer 2

滿足您需要的另一種方法是使用locals()函數，該函數返回一個字典，該字典包含本地范圍的整個變量集，變量名作為鍵，其內容作為值。

for i in aminoacids:
    codondict[i] = locals()[i]

因此，您可以使用以下方法獲取A列表： locals()['A'] 。

Answer 3

這有點冗長，並且使變量'A'的名稱與值A混淆。 保持您所擁有的：

aminoacids = { 'A': A, 'C': C, 'D': D ... }

應該為您提供您要的字典：

{ 'A' : ['GCT', 'GCC', 'GCA', 'GCG'], 'C' : ['TGT', 'TGC'], ... }

其中鍵'A'和'C'的順序可能不是您返回的，因為字典沒有順序。

Answer 4

您也可以使用內置的globals（）和dict理解：

codondict = {k:globals()[k] for k in aminoacids}

最好像stummjr的解決方案那樣依賴locals（）而不是globals（），但是直接使用dict理解不能做到這一點

codondict = dict([(k,locals()[k]) for k in aminoacids])

但是，您可以這樣做：

loc = locals()
codondict = {k:loc[k] for k in aminoacids}

如果要徹底更改氨基酸列表或氨基酸分配，最好使用一些懶惰的方法，例如：

codondict = lambda: {k:globals()[k] for k in aminoacids}

最后，您始終可以使用更新的字典，但是現在它是可調用的，因此請使用codondict（）[x]而不是codondict [x]來獲取實際的字典。 這樣，您可以像hist = codondict（）一樣存儲整個dict，以防需要比較不同歷史版本的codondict。 它足夠小，可以在交互模式下使用，但是不建議在較大的代碼中使用。