如何確保R / Rcpp代碼可重現（“可分發”）？

Question

我已經為論文編寫了一些R代碼，依賴於一些外部包（例如， plyr和reshape ），並使用inline和RcppArmadillo編寫了幾個相對簡單的內聯C ++函數。

我想確保它可以在我自己的計算機（Win64）上“按原樣”執行，以用於研究再現性目的。

我的問題：假設我包含了安裝所需軟件包的代碼， RcppArmadillo （和Rcpp和inline ）軟件包是否足以能夠編譯RcppArmadillo編寫的函數，或者最終用戶是否需要更改系統路徑以便在其上編譯Windows機器？ 如果沒有，是否有可能/建議從我的結束保存編譯的功能，並包含在我發貨的R代碼中？

此外，在不太可能的情況下代碼應該運行一段時間（比如說，幾年），在當前版本中包含完整的R安裝以及相關軟件包以使代碼“面向未來”是足夠的？

我希望這個問題很清楚。

Answer 1

我認為你的意思是你的代碼是“可分發的”和“可由其他人執行”，這是一個更寬松的要求。 “可重復”意味着前一個問題是正確的，並且增加了結果相同的限制（直到你選擇的epsilon）。

“如何讓其他人運行我的R代碼”的通常答案是創建一個包。

對於與Rcpp相關的代碼，我們有一個完整的小插圖致力於使用您的Rcpp-using cod構建您自己的包。 小插圖被稱為'Rcpp-package'。