如何确保R / Rcpp代码可重现（“可分发”）？

Question

我已经为论文编写了一些R代码，依赖于一些外部包（例如， plyr和reshape ），并使用inline和RcppArmadillo编写了几个相对简单的内联C ++函数。

我想确保它可以在我自己的计算机（Win64）上“按原样”执行，以用于研究再现性目的。

我的问题：假设我包含了安装所需软件包的代码， RcppArmadillo （和Rcpp和inline ）软件包是否足以能够编译RcppArmadillo编写的函数，或者最终用户是否需要更改系统路径以便在其上编译Windows机器？ 如果没有，是否有可能/建议从我的结束保存编译的功能，并包含在我发货的R代码中？

此外，在不太可能的情况下代码应该运行一段时间（比如说，几年），在当前版本中包含完整的R安装以及相关软件包以使代码“面向未来”是足够的？

我希望这个问题很清楚。

Answer 1

我认为你的意思是你的代码是“可分发的”和“可由其他人执行”，这是一个更宽松的要求。 “可重复”意味着前一个问题是正确的，并且增加了结果相同的限制（直到你选择的epsilon）。

“如何让其他人运行我的R代码”的通常答案是创建一个包。

对于与Rcpp相关的代码，我们有一个完整的小插图致力于使用您的Rcpp-using cod构建您自己的包。 小插图被称为'Rcpp-package'。