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[英]Creating a ternary plot from Cartesian coordinates
我正在嘗試一些事情 - 我想通過混合三角形估計來自來源的貢獻。 我有笛卡爾系統中的所有數據點(測量了 2 個示蹤劑)現在我需要將我的坐標轉換為三線性坐標。 我正在尋找一個預先存在的 function 或其他方式來自行計算它。 有人能幫我嗎? R 中是否已經存在某些東西? 如果我沒有誤解手冊,g ...
[英]Creating a ternary plot from Cartesian coordinates
我正在嘗試一些事情 - 我想通過混合三角形估計來自來源的貢獻。 我有笛卡爾系統中的所有數據點(測量了 2 個示蹤劑)現在我需要將我的坐標轉換為三線性坐標。 我正在尋找一個預先存在的 function 或其他方式來自行計算它。 有人能幫我嗎? R 中是否已經存在某些東西? 如果我沒有誤解手冊,g ...
[英]How do I specify a model in a ternary plot (ggtern) in R?
我正在嘗試使用 packacke ggtern 重現三元 plot 。 這是一個最小的工作示例(我從 Lawson and Willden (2016) 那里得到這個): 現在我想使用ggtern 重現這個 plot 。 我的想法如下: 但這將在geom_interpolate_tern中返回一條 ...
[英]Plotting ternary graph with imported excel sheet
我有許多繪制簡單三元圖的 excel 表(附示例)。[![basic excel sheet layout][![1]][1]][1] 這目前用於繪制形狀的簡單三元圖 [![在 excel 中生成簡單的三元圖][![2]][2]][2] 左邊的比例是 c:a 比率,右邊是 b:a 底部的比率是 ...
[英]Plot every 3 columns (as x,y,z) in a data frame function
我有一個數據框,每個三元組有 3 個三元軸,如下面的玩具示例 我的目標是使用庫ggtern::ggtern()為每個三元組(t1、t2、t3 等)獲取每 3 列(x、y、z)和 plot 首先我創建這個正則表達式向量: 然后遍歷它並將其與grep結合以獲取每組 3 列,然后以某種方式獲取 plot ...
[英]ggtern custom function object x not found error
我正在嘗試使用 package ggtern 創建一個自定義 function 繪制三元ggtern 這是數據和 function 的示例 當我像這樣在 myData 上運行 function 時: drawTriad(myData, T_x, T_y, T_z) 我收到以下錯誤: FUN(X[[i ...
[英]How to graph, using ggplot2, a data frame with 3 independent discrete variables and a continuous dependent variable? (Other packages are welcome too)
我有一個包含 3 個離散變量和獨立變量的數據框。 這些變量相互組合,組合的結果為每組(連續和數值因變量)生成一個值。 到目前為止,我還不能用一個 plot 來表示這個結果。 我已經嘗試制作表面圖,但這種類型的 plot 只允許 2 個自變量和一個因變量。 我也試過做一個三元的plot,但是這種圖的 ...
[英]ggtern - create contoured ternary plot
我正在嘗試使用“ggtern”包創建一個帶有輪廓填充的三元圖。 目的是創建一個如下所示的類似圖,其中每個三角剖分點 (EXT;INT;SA) 表示一個值 MF... 我正在使用“stat_interpolate_tern()”函數,基於 stackoverflow 社區的友好支持, 請參見此處 ...
[英]Is there any alternative to ggtern in R?
看起來 ggtern 尚未與新版本的 ggplot2 同步。 因此我們不能使用ggtern。 除了 R 中的 ggtern 之外,是否有人可以找到其他三元圖選項? ...
[英]Error: geom_point requires the following missing aesthetics: x and y
如果我使用以下命令: 一切正常。 如果我運行以下命令: 我收到此錯誤消息: 錯誤:geom_point 需要以下缺失的美學:x 和 y ...
[英]How to use position_jitter_tern() in ggtern() in R?
我正在創建一個簡單的三元 plot。 如何抖動該點以使 plot 顯示兩個點? 我嘗試像這樣使用 position_jitter_tern:但它沒有改變任何東西。 圖像可以在這里看到 ...
[英]Ternary Diagrams in R - ggter 3.3.0 vs older versions
我在鏈接中看到了一個非常有趣的三元圖模板,由 Nicholas Hamilton 制作: 三元 plot 和填充輪廓代碼如下: 問題是隨着此 package 的更新,會出現一些錯誤: 問題是geom_density2d和stat_density2d不再支持並被geom_density_tern和s ...
[英]How to combine three ternary diagrams on one figure with ggtern
如何用ggtern在一個圖形上組合三個三元圖我用下面的代碼plot三個三元圖,想把三個三元圖(三個三元圖中的所有點)組合在一個三元圖上,保持點的顏色和position不變: ...
[英]How to modify the ternary diagrams with ggtern
如何用ggtern修改三元圖 我使用以下代碼繪制三元圖,並希望進行一些更改: 將 x, y, z 的刻度標簽修改為概率數 (0.2 0.4 0.6 0.8 1.0) 刪除 x、y、z 的側箭頭和相應的文本。 刪除第二個圖例(灰色/白色) 用“高”和“低”替換第一個圖例中的文本 ...
[英]Increase arrow thickness in ternary plot [ggtern]
這是一些示例代碼。 如何增加箭頭和箭頭的粗細? 一旦我開始增加標簽的大小,它們就太薄了。 另外,如何將參數 base_size 與 ggtern 主題一起使用? 因為它似乎只適用於某些主題,如果我想放大所有內容,包括箭頭,我不確定我是否正確使用它。 ...
[英]What makes a dot plot on top of another on geom_point? And how to change it?
是什么使值點圖重疊並繪制在 ggtern 圖上的另一個頂部? 我該如何改變它? 我想將我選擇的彩色觀察結果繪制在黑色觀察結果之上。 (在我的數據中,我有 1400 個觀察值,即使點尺寸較小,這種情況仍然會發生) 現在: 我曾嘗試將顏色更改為 'white' col<-rep("whi ...
[英]Fill by geom_point and black outline in a ggtern
如何使用選定的填充紅色/藍色和黑色輪廓為 A 和 D 着色。 檢查我的 <geom_point> 以查看我嘗試過的內容。 謝謝! 期望的輸出: ...
[英]Add variable function label to ternary plot in R
我想將我的數據繪制為三元圖,其中基因在三種條件之一下上升或下降,即。 更接近顯示更高值的條件。 每個變量的值是否獨立於值而標准化? 我可以向選定的“基因”變量添加標簽,該變量聲明變量“func2”嗎? 這是我獲得的(頂部)和我想要的(底部)的可重現示例 ...
[英]missing aesthetics with shiny and ggtern
我想使用 Shiny 創建一個三元 plot 儀表板。 但我陷入了這個錯誤。 此代碼采用 CSV 文件並更新三個下拉輸入。 然后創建的三元 plot 具有這三個下拉值。 問題是在將“geom_point()”添加到 obj 時出現此錯誤 -> CoordTern 需要以下缺失的美學 (tlr- ...
[英]Error CoordTern requires the following missing aesthetics (tlr->xy) : z when using ggtern in Shiny
我正在嘗試編寫一個 Shiny 應用程序,該應用程序讀取由三個組件系統組成的文件並使用 ggtern package 繪制三元相圖。 我可以在基本的 R 中執行此操作,但是當嘗試將其作為 Shiny 的一部分來實現時,我得到一個錯誤,我不確定如何修復: 錯誤:CoordTern 需要以下缺失的美學 ...
[英]ggtern breaks ggplot2 and produces plots without axis labels etc
我注意到,自從ggplot2發布了他們的新版本(3.3.0),我不能再使用包ggtern ,因為它完全破壞了我用ggplot2生成的所有圖。 這會產生一個正常的情節: 但是,當我加載ggtern 時,我得到以下信息: 沒有軸等: 當我分離ggtern時它也保持這種狀態,所以我必須重新 ...