標簽[statnet] - 堆棧內存溢出

[英]Generate network using adjacency matrix

我在生成 .network object 時遇到問題，以便在 R 中進行進一步的 ergm 估計。也就是說，當我為 .network function 提供鄰接矩陣時，它會生成一個錯誤，即 my.network 包含循環和多條邊，這根本不是真的。大約兩年前，我用相同的矩陣運行了相同的代碼，一切正常 ...

使用節點屬性模擬 ERGM

[英]Simulate ERGM with nodal attributes

我想知道是否有可能模擬來自 ERGM 分布的網絡，其中節點具有屬性。例如，如果我想模擬 a.network ，其中具有相似屬性的節點之間的三角形更有可能出現，我會做類似的事情：但問題是，這些依賴於節點屬性（例如nodematch ）的統計信息需要參數，我沒有這些參數，因為 .network 事 ...

如何解決ergm退化？

[英]how to resolve the ergm degeneracy?

這是一個需要您幫助的問題。我使用 ergm 來 model 的形成。網絡。但它總是退化。只有 174 個節點（頂點），304 度。我使用代碼如下問題是從參數-----gwesp(0.2,fixed=T)和gwdegree(2,fixed=T)),速度很慢，報錯如下：Estimating eq ...

當我在圖中使用簡化時繪制圖形的問題

[英]Problem of plotting graph when I use simplify, in graph

我想 plot 我的圖表。我提供了一個樣本數據集。我用simplemented來去除循環，但它完全影響了數據的結構。當我 plot 數據不使用簡化時，我有正確的頂點和邊緣着色但有循環。我使用簡化來刪除循環和它之后的顏色，這是錯誤的，因為它的每個節點和邊緣都應該具有與我在代碼中定義的顏色相同的 ...

使用 igraph 將節點度設置為節點屬性

[英]Set node degree as a node attribute, using igraph

我想把每個節點的度數作為一個頂點屬性，我的代碼如下，但是它不起作用，問題可能出在哪里？ ...

鄰接矩陣不對稱的錯誤

[英]Error that the adjacency matrix is not symmetric

我的數據集如下，我想創建一個網絡，但錯誤是我的鄰接矩陣不是對稱的，我是 R 的新手，我不知道如何將我的數據轉換為對稱鄰接矩陣，任何人都可以幫助我請？我試過的代碼 ...

為什么在指數隨機圖模型 (ergm) 中引入“blockdiag”約束參數會大大減慢計算速度？

[英]Why introducing a 'blockdiag' constraints argument in exponential random graph models (ergm) drastically slow down the computation?

我正在嘗試在加權網絡（network_ex）上運行一個有價值的指數隨機圖 model（ergm）。該網絡顯示了四個不同組中的個人之間的交互。組之間不能發生交互，因此需要在 model 中包含塊對角約束。然而，當我包含這個塊對角約束時，計算會在蒙特卡洛最大似然估計的特定迭代上卡住至少 24 小 ...

使用動態網絡可視化更改節點顏色

[英]Changing node color with dynamic network visualisation

我正在嘗試創建一個網絡 animation 來顯示節點如何隨時間變化 state。用例是 Covid-19 的接觸者追蹤。我使用了基於代理的 model 來模擬 Covid-19 的傳播。從這里我提取了我的聯系網絡。我正在努力弄清楚 tsna package 如何在每個時間片上更改節點顏色（ ...

發出具有塊對角約束的運行值指數隨機圖 model (ergm)

[英]issue running valued exponential random graph model (ergm) with block diagonal constraint

我正在嘗試在加權網絡（network_ex）上運行指數隨機圖 model（ergm）。該網絡顯示了四個不同組中的個人之間的交互。組之間不能發生交互，因此需要在 model 中包含塊對角約束。但是，當我包含塊對角線約束時，ergm function（否則運行）會返回錯誤（見下文），而我的 R ...

如何計算 ERGM 預測概率的標准誤？

[英]How to calculate the standard errors of ERGM predicted probabilities?

我無法根據 ERGM model 的預測概率估計標准誤差來計算置信區間。獲得預測概率不是問題，但我想了解預測周圍的不確定性。下面是一個基於文藝復興時期佛羅倫薩家庭婚姻和商業關系數據集的可復制示例。根據 model，估計財富差 10 對應於平局的概率為 0.182511。我的第一個問題是，這 ...

ndtv 中的動態頂點屬性

[英]Dynamic vertex attribute in ndtv

我一直在嘗試在 ndtv 中實現動態頂點屬性，實際上我設法創建了不同大小的頂點，但經過仔細檢查，它們與我認為我指定的值不對應。相反，頂點大小與第一個 ID 具有最大大小的頂點 ID 成正比。我試圖通過為每個周期創建一個頂點拼寫來控制大小，並為大小參數設置不同的值導致以下結果，其中 vs 是頂點 ...

在 R 中使用兩個邊緣屬性建模 ERGM

[英]Modeling ERGM with two edge attributes in R

我有一個場景，其中一個邊緣屬性影響另一個邊緣屬性。有沒有辦法在 ERGM 中實現 model？例如，考慮合同復雜性影響合同價值的外包合同。我想 model 以一種我可以使用復雜性預測具有合同價值的網絡的方式評估 ERGM。我知道我們可以在 ERGM 建模中使用節點屬性，是否可以 model ...

如何在 R Statnet 中識別分離株並刪除它們

[英]How do I identify isolates and delete them in R Statnet

如何在 R Statnet 中識別分離株並刪除它們？這是一個示例代碼。這將生成一個網絡，其中頂點 6、7、8、9、10 沒有連接。這些是隔離。所以我的問題是如何識別隔離並將它們從 Statnet 庫中的網絡中刪除。 ...

從數據框中的二進制和字符變量創建 two-mode.network

[英]Creating two-mode network from binary and character variables in data frame

SNA 人員：我正在嘗試從 R 中的數據框創建一個 two-mode.network。我有一個組織列表，這些組織通過父組織中的共同成員資格連接。我在那個用二進制變量編碼的組織中有成員資格。我已經通過以下代碼（來自Create adjacency matrix based on binary ...

具有三維邊緣列表的網絡？

[英]Network with three-dimensional edgelist?

我有數據提供有關參與者 c 的信息流，按源自源 s 的輸入細分到合作伙伴 p。網絡數據通常只有一種信息：數據/信息流從 A->B、B->C 等。但是，我的數據顯示哪些從 A->B 流向 C，哪些從 A->B 流向 D。數據結構為三列邊緣列表。我有點不明白如何 ...

在ggnet中使用顏色

[英]Using color in ggnet

我有一個我這樣制作的網絡：我使用此代碼將其轉換為網絡對象我相信我的代碼應該從我的邊緣列表創建一個網絡並創建一個名為 value 的聯系屬性我想可視化這個矩陣，並在數字大時將節點顏色設置為深藍色，數字小時將節點顏色設置為淺藍色我試過這個代碼我只得到三個節點和三個領帶，一切都是黑色 ...

如何在二分投影中將模式轉換為屬性

[英]How to convert mode into an attribute in bipartite projection

我有一個關於在轉換為單模式投影后保留節點信息的快速問題。我想使用公司與公司的關系作為我的新邊緣列表，但保留交易編號作為邊緣屬性，以便我理想地擁有一個如下所示的新數據集：源目標交易 AB 14 CD 15 fg 17 哈 18 其中“來源”、“目標”和“交易”都在各自的列中。（對不 ...

Plot 網絡與 statnet 中的 GPS 坐標

[英]Plot network with GPS coordinates in statnet

是否可以使用坐標作為節點布局來 plot 網絡 object ？我不想在 map 上對它們進行 plot，而只是為了根據它們的緯度/經度 position 顯示節點之間的物理距離。數據借自：在 igraph r-package 中使用地理坐標作為頂點坐標 ...

將網絡划分為社區的結果可視化

[英]Visualizing the result of dividing the network into communities

數據集包括網絡矩陣和屬性數據框。網絡數據集本身有 3 個數據集，我只想處理PrinFull數據集以及 PRIN 屬性數據。我的數據在下面的這兩個鏈接中上傳。我在我的數據集上添加了所有屬性。 https://drive.google.com/file/d/1MZCdeAZF0joIQLwVe ...

networkDynamic 的 edge.spells 參數的開始時間列必須是數字

[英]the onset time column of the edge.spells argument to networkDynamic must be numeric

I am trying to create a networkDynamic object and have tried following all of skyebend's suggestions in oymonk's post how upload a dataframe to ndtv ...