我想在 PyMC3 中实现基本的 model 捕获和重新捕获(捕获 100 只动物并标记它们,然后释放它们并在它们混合后重新捕获其中的 100 只并注释标记了多少)。 这是我的代码: 但是我在plot_ppc中得到错误'var names: "[\'likelihood\'] are not pre ...
我想在 PyMC3 中实现基本的 model 捕获和重新捕获(捕获 100 只动物并标记它们,然后释放它们并在它们混合后重新捕获其中的 100 只并注释标记了多少)。 这是我的代码: 但是我在plot_ppc中得到错误'var names: "[\'likelihood\'] are not pre ...
运行代码 az.plot_trace(result_final); 面临以下错误TypeError: expected dtype object, got 'numpy.dtype[float64]' 上述异常是以下异常的直接原因: SystemError: CPUDispatcher(<0 ...
我有一个来自 PyMC3 的样本,我试图从中获得累积概率,例如 P(X < 0)。 我目前使用这个: 有没有更好的方法来做到这一点,或者使用来自 Arviz 或 XArray 的一些帮助程序 function? 我还没有找到任何.cdf()方法或类似的东西。 奇怪的是缺少这些基本功能,但有更高 ...
以明显的方式( conda install -c conda-forge arviz )安装ArviZ后,出现以下故障。 如果有人能阐明如何解决这个问题,那就太好了。 按照@merv 的建议,我得到以下内容,它解释了问题(它是一个不同的 package,称为 snappy,用于计算拓扑)。 但是我该 ...
我正在尝试将非对称高斯拟合到我的数据中。 我的数据只是一个名为 wave (x) 的 numpy 数组和一个名为 spec (y) 的 numpy 数组,看起来像一个非对称高斯。 这是带有非对称高斯拟合曲线拟合数据的图像(这也有连续统,但这现在并不重要。 这是函数: 我正在使用此代码来拟合参 ...
我正在使用 python 版本 3.8.5 的 Spyder IDE,我使用的是 pymc3(不记得确切版本),它工作正常,升级 scipy、spyder 和 python 后,一切都变得混乱。 我花了过去 2 天的时间试图解决这个问题,每次我安装 pymc3 并运行程序时,我都会收到关于 thea ...
我正在使用 python 中的 pyMC3 库估计 model。 在我的“真实”model 中,有四个参数 arrays,其中两个参数超过 170,000 个。 总结这组参数在我的计算机上的计算量太大。 我一直在试图弄清楚 arviz 中的汇总 function 是否允许我仅汇总数组中的一个(或少量 ...
我是 python 和 pymc3 的新手。 如果这个问题相当愚蠢,请原谅我。 我有一个名为 toy_data.csv 的数据集: 批号 batch_id 积分 pred1 pred2 12-150 1 1 70.26 10.766 12-150 1 2 65.72 10.51 ...
我正在尝试生成我的 model 的跟踪 plot 但它显示module 'pymc3' has no attribute 'traceplot'错误。 我的代码是: 然后给出以下错误: 我在windows10上,我已经下载了带有pip的pymc3,因为它不包含在我下载的anaconda中。 ...
通常,我发现我们使用pm.binomial()等等。 并使用 pm.plot_posterior 我们得到离散图,我的问题是为什么我必须得到的图是曲线? 有人可以启发我吗? 我想得到: 但我得到了图表: ...
我正在使用 PyMC3 学习统计反思课程。 在第 4 章的末尾,他们要求提供不在原始 (.Kung) 数据集中的数据点的单个值的 HDI? 在 PyMC3 中可以这样做吗? 在 scikit-learn 中,您有fit()和predict() ,并且您能够预测 output 以获得全新的输入。 使 ...
我有一篇旧博文,我正在训练 PyMC3 模型。 您可以在此处找到博客文章,但模型的要点如下所示。 with pm.Model() as model: mu_intercept = pm.Normal('mu_intercept', mu=40, sd=5) mu_slope = pm ...
我有一个数据集,我们称它为 A,当我打印时它看起来像这样: 但现在我想提取 158.0 和 725.2 并将它们保存在一个单独的数组中,但我不知道如何获取这些值。 我试过 Ax、A.get() 等。谢谢! ...
假设我使用 pymc3 为伽马分布生成了一些样本数据: 现在,我将创建一个模型来拟合该数据的伽马分布: 这将正确获得创建原始假数据的值和分布。 现在,我想绘制 pdf(但我不知道该怎么做!)。 我看到了一个这样做的例子: 它创建了一个矩阵,其中包含来自估计 pdf 的样本。 我用以下 ...
我正在玩 PyMC3,试图在 PyMC3 文档中适应采矿灾难开关点 model的修改版本。 假设您有两个煤矿(mine1 和 mine2),每个煤矿在相同的年份范围内具有相似的灾难计数。 然而,mine1 在实施降低灾难次数的安全程序变更方面晚了 5 年: 我有兴趣测试更好的 model 是否适合 ...
我正在尝试更改我正在使用 Arviz 创建的 plot 的标题。 通常我已经使用backend_kwargs完成了此操作,但它似乎不适用于某些地块:在本例中为plot_density 。 这是我正在使用的代码: 它识别出kwargs的高度变化,所以它不像没有注意到它们在那里。 我还尝试了其他变体,例 ...
我正在尝试使用 pymc3 和 arviz 获得 2D mcmc 链的有效样本大小 上面的代码适用于 1D,但不适用于 2D,我看到有一个 az.convert_to_dataset 可能会有所帮助,但我不知道如何使用它? 样本将是一个 N x 2 数组,它应该只给出一个数字,如 output 谢谢 ...
我正在使用 python 研究贝叶斯分析一书,并尝试在 python 中实现所有代码,为此我使用 google colab,但是当我运行书中的以下代码时 它给出了这样的错误: 在我尝试实现这些库之前 但仍然没有成功。 如何修复此错误? ...
我正在尝试为多个组可视化具有最高后验密度(hpd)的简单线性回归。 但是,我在为每个条件应用 hpd 时遇到问题。 每当我运行这段代码时,我都会为每个条件提取相同的后验密度。 我想可视化与其条件相对应的后密度。 如何为每个组提供 plot hpd? 编辑:问题已在PyMC3 话语中得到解决 ...
我需要做些什么才能在 PyCharm 中显示我的 PyMC3 plots.traceplot结果吗? 我刚刚发现我需要一个pm.summary()周围的print()语句。 所以我想知道这些情节是否还有另一个 function 。 谢谢你! ...