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PyMC3/Arviz:来自跟踪的 CDF 值 - PyMC3/Arviz: CDF value from trace

我有一个来自 PyMC3 的样本,我试图从中获得累积概率,例如 P(X < 0)。 我目前使用这个: 有没有更好的方法来做到这一点,或者使用来自 Arviz 或 XArray 的一些帮助程序 function? 我还没有找到任何.cdf()方法或类似的东西。 奇怪的是缺少这些基本功能,但有更高 ...

奇怪的`ArviZ`安装问题 - strange `ArviZ` installation issue

以明显的方式( conda install -c conda-forge arviz )安装ArviZ后,出现以下故障。 如果有人能阐明如何解决这个问题,那就太好了。 按照@merv 的建议,我得到以下内容,它解释了问题(它是一个不同的 package,称为 snappy,用于计算拓扑)。 但是我该 ...

在pymc3中拟合非对称高斯参数 - Fitting asymmetric gaussian parameters in pymc3

我正在尝试将非对称高斯拟合到我的数据中。 我的数据只是一个名为 wave (x) 的 numpy 数组和一个名为 spec (y) 的 numpy 数组,看起来像一个非对称高斯。 这是带有非对称高斯拟合曲线拟合数据的图像(这也有连续统,但这现在并不重要。 这是函数: 我正在使用此代码来拟合参 ...

pymc3、arviz 和 theano 包的稳定版本是什么? - what is stable release version with regards to pymc3, arviz and theano packages?

我正在使用 python 版本 3.8.5 的 Spyder IDE,我使用的是 pymc3(不记得确切版本),它工作正常,升级 scipy、spyder 和 python 后,一切都变得混乱。 我花了过去 2 天的时间试图解决这个问题,每次我安装 pymc3 并运行程序时,我都会收到关于 thea ...

使用 arviz 汇总数组中单个参数的后验 - Summarise the posterior of a single parameter from an array with arviz

我正在使用 python 中的 pyMC3 库估计 model。 在我的“真实”model 中,有四个参数 arrays,其中两个参数超过 170,000 个。 总结这组参数在我的计算机上的计算量太大。 我一直在试图弄清楚 arviz 中的汇总 function 是否允许我仅汇总数组中的一个(或少量 ...

pymc3 是否具有与 scikit-learn 中的预测方法等效的方法? - Does pymc3 have an equivalent for the predict method in scikit-learn?

我正在使用 PyMC3 学习统计反思课程。 在第 4 章的末尾,他们要求提供不在原始 (.Kung) 数据集中的数据点的单个值的 HDI? 在 PyMC3 中可以这样做吗? 在 scikit-learn 中,您有fit()和predict() ,并且您能够预测 output 以获得全新的输入。 使 ...

使用 pymc3 绘制伽马分布的拟合图 - Plot fit of gamma distribution with pymc3

假设我使用 pymc3 为伽马分布生成了一些样本数据: 现在,我将创建一个模型来拟合该数据的伽马分布: 这将正确获得创建原始假数据的值和分布。 现在,我想绘制 pdf(但我不知道该怎么做!)。 我看到了一个这样做的例子: 它创建了一个矩阵,其中包含来自估计 pdf 的样本。 我用以下 ...

PyMC3 - 煤矿灾难示例 - 问题回复:添加第二个矿井 - PyMC3 - coal mining disaster example - questions re: adding a second mine

我正在玩 PyMC3,试图在 PyMC3 文档中适应采矿灾难开关点 model的修改版本。 假设您有两个煤矿(mine1 和 mine2),每个煤矿在相同的年份范围内具有相似的灾难计数。 然而,mine1 在实施降低灾难次数的安全程序变更方面晚了 5 年: 我有兴趣测试更好的 model 是否适合 ...

Arviz 和 Bokeh:尝试使用后端 kwargs 更改 plot 的标题 - Arviz and Bokeh: Trying to change the title of the plot using backend kwargs

我正在尝试更改我正在使用 Arviz 创建的 plot 的标题。 通常我已经使用backend_kwargs完成了此操作,但它似乎不适用于某些地块:在本例中为plot_density 。 这是我正在使用的代码: 它识别出kwargs的高度变化,所以它不像没有注意到它们在那里。 我还尝试了其他变体,例 ...

使用 arviz 和 pymc3 mcmc 的有效样本大小二维数组 - effective sample size 2d array using arviz and pymc3 mcmc

我正在尝试使用 pymc3 和 arviz 获得 2D mcmc 链的有效样本大小 上面的代码适用于 1D,但不适用于 2D,我看到有一个 az.convert_to_dataset 可能会有所帮助,但我不知道如何使用它? 样本将是一个 N x 2 数组,它应该只给出一个数字,如 output 谢谢 ...

Google colab 存在一些与贝叶斯分析和相应库相关的问题 - Google colab has some issues related to the Bayesian analysis and corresponding libraries

我正在使用 python 研究贝叶斯分析一书,并尝试在 python 中实现所有代码,为此我使用 google colab,但是当我运行书中的以下代码时 它给出了这样的错误: 在我尝试实现这些库之前 但仍然没有成功。 如何修复此错误? ...

PyMC3 和 Arviz:使用 arviz plot_hpd 可视化多种条件下的最高后验密度 - PyMC3 and Arviz: Visualizing highest posterior density for multiple conditions using arviz plot_hpd

我正在尝试为多个组可视化具有最高后验密度(hpd)的简单线性回归。 但是,我在为每个条件应用 hpd 时遇到问题。 每当我运行这段代码时,我都会为每个条件提取相同的后验密度。 我想可视化与其条件相对应的后密度。 如何为每个组提供 plot hpd? 编辑:问题已在PyMC3 话语中得到解决 ...


 
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