我在Python中使用NetworkX库编写了一段代码来查找连接的球体路径。 为此，我需要在使用图形之前找到球体之间的距离。 这部分代码（计算部分（ numba函数）--> 查找距离和连接）导致 memory 在numba并行方案中使用 arrays 时出现泄漏（我在使用np.linalg或s ...
我正在使用graph_tool绘制一些图形，但我看不到为 output 图像添加标题的明显方法。 如果可能的话，如何添加标题？ 我现在拥有的代码绘制了一个漂亮的图形，并且我已经为顶点添加了注释。 但我还没有找到一种方法来注释整个图表（如标题）。import graph_tool as gt de ...
我有几个功能要添加到我的图中的每个顶点。 我知道将顶点属性添加到图形的方法如下：g = Graph() g.set_directed(False) vprop_feature_name = g.new_vertex_property("int") g.vp.feature_name = vprop ...
我正在学习 python 并且正在使用模块 graph_tool 做一些实验。 由于 function all_circuits 可能需要很长时间来计算所有周期，有没有办法停止 function（例如在“X”秒后或迭代器达到一定大小后）并继续执行脚本？ 谢谢 ...
我正在尝试使用graph-tool ，但无法在 pip 或pypi中找到它不使用 conda 时如何获取它？ 请注意我不是指图形工具 ...
我曾与networkx合作过，正在尝试graph-tool以获得更好的性能。 通过文档，我希望创建具有属性的边缘。 在networkx ，我可以为一些图G做这样的事情： 我想在graph-tool中做同样的事情。 从文档中，我尝试了示例，其中一个属性在 python dict而不是int中略有变化 ...
我知道存在用于计算 NetworkX 中图的连接组件大小的函数。 您可以将属性添加到节点。 在 Axelrod 的文化传播模型中，一个有趣的度量是其节点共享多个属性的最大连接组件的大小。 有没有办法在 NetworkX 中做到这一点？ 例如，假设我们有一个通过网络表示的人口。 每个节点都有头发颜色和 ...
我正在使用 2 种方法计算 4 个网络的网络社区： 'Leiden' 方法，它给了我 7 (a)、13 (b)、19 (c)、22 (d) 社区。 “随机块模型”，还通过检查层次结构的级别来检查节点的组成员资格，如下所示： 打印： 并绘制： 与使用 Leiden ...
在graph-tool vertex percolation process 的文档中，有一个称为comp的量定义为带有组件标签的顶点属性 map。 我想知道这是否是指连接组件的数量（我对此感兴趣）。 当我为图形运行模拟时，我得到一个 object，它总是返回相同的数字。 ...
图形工具中是否有一种方法可以检查两个节点是否连接（作为第一邻居）而无需迭代？ 例如，类似graph_tool.is_connected(v,u)的东西会返回 boolean，具体取决于v和u是否为连接顶点。 像 function 这样的东西来检查是否存在某个边缘。 谢谢 ...
我正在尝试从邻接矩阵生成图形。 我知道这是已经在这里问过的东西，但我无法正确生成一个。 我的代码是 它生成一个邻接矩阵，每个连接发生的概率为 60%。 一个结果是 但我不知道为什么图形结果是这个明显不正确的结果。 ...
我尽力在网上寻找解决方案，但似乎找不到适合我的graph_tool网络的解决方案。 我有一个 pandas dataframe df ，它有三列： id_source ， id_target ， weight 。 id_source和id_target包含文本形式的名称。 我想将它们用作顶点标签 ...
我在我的 python 应用程序中使用 pika 1.1 和图形工具 3.4。 它使用来自 RabbitMQ 的任务，然后使用图形工具构建图形，然后运行一些计算。 一些计算，例如介数，会占用大量的 cpu 功率，从而使 cpu 使用率长时间达到 100%。 有时 rabbitmq 连接断开，导致任务 ...
我有一个带有方法save()的函数G ，它采用文件 obj 或文件名字符串。 我可以保存到磁盘。 但是我也有关联变量，比如var1 ， var2 ，我想包含它们而不将它们保存在附加文件中。 如何保存到内存文件，将其包含在字典中并对其进行腌制？ 或者你会怎么做？ 就像是： out = { ...
从字面上看，昨天我所有使用图形工具库的 colab 笔记本都正常工作。 我需要做的就是在开头添加以下几行： 然后我会写from graph_tool.all import *一切都很好。 这些说明是根据官方笔记本https://colab.research.google.com/github/cou ...
我想计算无向加权图中每对节点之间的所有最短路径。 我目前正在使用graph_tool.topology.shortest_distance ，来自 graph_tool python 库，但它似乎只在一个核心中运行。 有没有办法让它并行运行？ ...
我按照以下链接中的图形工具安装说明进行操作（ https://colab.research.google.com/github/count0/colab-gt/blob/master/colab-gt.ipynb#scrollTo=d_j7nNbKRmhx ）。 但是，它会引发以下错误 ...
我对图形可视化和图形工具（gt）等软件非常陌生。 我的主要领域是数学，但我对 Python 和一般编程有点熟悉。 但是，我不是程序员，所以我的代码可能不够优雅； 任何改进建议将不胜感激。 描述： 我非常喜欢用于可视化非常大的图形的带有边缘捆绑的圆形布局。 例如，我正在尝试使用 Tiago Peixo ...
我从http://users.cecs.anu.edu.au/~bdm/data/graphs.html下载了一堆图表，我想做一些分析。 我想为此使用graph-tool Python 模块，但我找不到从graph6格式转换为与graph-tools兼容的格式的便捷方法。 必须有一个简单的方法来做到 ...
我一直在使用SBM 算法，在图形工具 package中实现。 我需要处理大量数据并且需要并行运行。 我知道 OpenMP 在这个 package 中默认激活，并在特定和兼容的算法中使用，但文档没有指定哪些算法。 我已经尝试过openmp_enabled()或openmp_set_num_threa ...