我是 imageJ 的初学者。 我想开始使用脚本工具,我开始编写一个简单的 function 如下所示,将已加载到 imageJ 中的图像上的单个像素标记为白色 我将其保存为目录“imageJ/macros”中名为“MarkPixel.ijm”的文件现在我运行 imageJ,打开图像,启动宏-&g ...
我是 imageJ 的初学者。 我想开始使用脚本工具,我开始编写一个简单的 function 如下所示,将已加载到 imageJ 中的图像上的单个像素标记为白色 我将其保存为目录“imageJ/macros”中名为“MarkPixel.ijm”的文件现在我运行 imageJ,打开图像,启动宏-&g ...
我正在尝试分析用于 cFos 分析的共聚焦显微镜图像。 从maxstacked图像中,我取了DAPI的ROI,放大了ROI来检测转基因标记的表达程度。 所以我可以发现转基因Piezo1的表达是否与cFof水平的增加有关。 这就是问题所在,当我通过以不同方式处理 DAPI 图像来获取 ROI 两次时效 ...
我有大约 30 张图像,并使用 ImageJ 宏来分析批次中的粒子(面积、圆度等)。 从我正在使用的宏脚本中,我无法单独保存结果,我的意思是每个图像一个 results.csv 文件。 脚本: ...
我想用斐济构建一个插件,在其中输入灰度的 avi 视频/帧序列和 output 没有黑帧的 avi/帧(删除它们)。 我想为此录制一个宏。 我下载了一个 avi 视频并将帧导入斐济。 怎样才能把上面的过程记录下来给我想要的结果呢? 我是斐济的新手。 先感谢您 ...
我正在为 ImageJ 开发宏。 目标是对上面有几个种子进行彩色扫描,然后在种子周围进行裁剪,以获得几个大小相同的图像,每个图像上都有一个种子。 这是宏的基本思想:提示 select 文件夹进行扫描(有关种子的信息在图像的名称中)> select 种子的阈值 > 在原始图像上围绕每个种 ...
我目前正在尝试使用 ImageJ/Fiji 一次批量处理大量实验室图像,但我很难让它处理图像。 每当拉起文件时,就会有三个图像被分成通道并在单独的 windows 中打开。 加工过程中选择了每一个window,需要进行不同的加工。 我目前正在尝试弄清楚如何根据特定参数而不是 window 的确切名称 ...
我在斐济有一个宏,我正在使用waitForUser(“用于创建绘图”,“沿着单元格的直径画一条线并按OK”)代码,我想保存用户绘制的线的坐标,有人可以帮助如何做到这一点吗? ...
我正在尝试使用宏在图像中的选定 ROI 上随机放置 n 个点; 但是现在,我想要一个条件,即我不应该在 (x-1,y-1), (x+1,y+1) 邻域中得到 (x,y)。 我怎样才能在代码中写这些? (没有 2 个点应该更接近 1 个像素)。 ...
我正在处理一个父文件夹的多个子目录中的大量图像文件。 我正在尝试运行 ImageJ 宏来批处理图像(具体来说,我正在尝试将在显微镜上拍摄的一系列图像拼接成单个图像)。 不幸的是,我不认为我不能将它作为 ImageJ 宏运行,因为图像是用不同的网格大小拍摄的,即有些是 2x3,有些是 3x3,有些是 ...
我在 ImageJ 中编写了如下代码。 但是图像 window 不是在打开时创建的。 我想将所有 tif 文件加载到文件夹中并查看它们。 ...
我想知道是否可以写入宏以重复 imageJ 中宏的一部分。 我有一个代码 而不是复制和粘贴 20 次,我想找到一个 function 来运行它,比如说 x20。 谢谢您的帮助! ...
我尝试用斐济分析图像。 因此,我首先使用 set scale run(“Set Scale…”, “distance=52.6 known=30 pixel=1 unit=no global”); 然后制作一个矩形,如图所示: Pic 1 。 然后我用run(“Measure”);执行测量。 并尝试 ...
我是 ImageJ 和 ImageJ 宏的新手。 我开始制作一个在图像上应用“Find Maxima”function 的宏。 然后我想测试每个被发现为最大值的像素以按值过滤它们。 如何将选择的所有点循环到我的宏中? 谢谢 ...
我是 ImageJ 宏的新手,我想在斐济使用宏。 宏的代码来自这个来源。 我已经下载了代码并将其保存为文本文件。 然后我通过转到插件>宏>运行来运行宏。 我使用的 ImageJ 版本是 1.53j。 但是,当我运行宏时,出现以下错误: 我在 ImageJ 论坛上在线看到这个宏适用于其他 ...
这里是 FIJI 和 ImageJ 的新手,所以如果这个问题对退伍军人来说听起来很愚蠢,我深表歉意。 我在这里遇到了一个非常酷的工具集,可以对激光扫描显微镜图像进行去模糊: http://image.bio.methods.free.fr/lsmtrans.html但我新下载的 FIJI 版本中缺少 ...
在使用 ImgaeJ 宏进行一些图像处理后,我有一个“结果”选项卡,其中包含 2 列 A 和 B。假设我有 50 行数据。 现在我想从 B 列上面的所有其他 49 行中减去最后一行的值。 在此之后,我想将所有值写入“.csv”文件(A、B 和 C 列,每列 49 个值)。 下面是部分代码。 我认为 ...
我正在尝试在 IJ1 中编写一个宏,它会询问用户: 他们要记录的事件数命名那些事件我开始使用脚本参数如下: 这不起作用,因为它不要求字符串。 即使它这样做了,我想它也不会很优雅,因为它会弹出一个 window 来询问一个名字 n 次(如果 50 次,那将是一场噩梦......) 最终,我想要: 方 ...
我有两个单独的文件夹,其中包含相同数量的显微镜图像(每个文件夹中有 134 个图像)。 这是针对特定细胞的两种不同染料。 我想要做的是将一个文件夹中的每个图像与另一个文件夹中的相应图像合并,即文件夹a的第一个图像与文件夹b的第一个图像等等。 我一直在尝试做这项工作,但由于每个图像都有不同的名称,我无 ...
我正在尝试在 Image J 中编写代码: 打开文件夹中以“-GFP.vsi”结尾的单独 windows 中的所有图像使用查找表将图像转换为绿色和 RGB 颜色 从 ImageJ,命令是: run("Green"); 并运行(“RGB 颜色”); 将每个图像保存在相同的原始文件夹中,名称相同,并保存 ...
我正在尝试创建一个宏,它将通过包含图像的文件运行循环。 要打开图像,我正在使用 Bio-Format 导入器,并且代码正在运行,但是,它每次都会提示我选择文件中的图像。 有没有办法让它自动运行文件? 这是我下面的代码...任何帮助将不胜感激.. 这些是我尝试过的其他一些格式,但仍然无法正常工作 ...