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执行网络元分析时使用 JAGS 出现子集错误的索引超出范围 - Index out of range taking subset error with JAGS while performing network metanalysis

我试图开发一个模型来运行带有锯齿的网络元分析,并尝试使用我已经在 WinBUGS 中使用过的以前的代码(并且工作正常)。 但是,当我尝试将它与 JAGS 一起使用时,它给了我一个编码错误,但它仍然可以很好地与 WINBugs 一起使用。 这是代码: 这是我给出的输入: 这是它给我的错误: ...

2022-07-23 00:24:51   1   15    r / jags / r2jags  
最新 JAGS 更新后结果不同? - Results different after latest JAGS update?

我正在使用 R2jags 在 R 中运行贝叶斯分层建模。 当我打开一个月前使用的代码并在一个月前使用的数据集上运行它时(通过 Windows 资源管理器中的“修改日期”验证),我得到的结果与一个月前不同。 我能想到的唯一区别是我上个月买了一台新的工作电脑,我们安装了 JAGS 4.3.0。 我以前使 ...

2022-07-19 00:10:33   1   28    r / jags / r2jags  
'R2jags::autojags()' 函数不收敛 - The 'R2jags::autojags()' Function Doesn't Converge

我正在运行以下代码: 当我运行这个贝叶斯模型时,我得到以下输出: 然后,当我尝试使用R2jags::autojags()函数时,我得到以下输出: 我的印象是这个函数会继续运行直到它收敛(直到Rhat达到1.1 )。 事实并非如此——第二个模型实际上具有更高的Rhat值。 我试过在auto ...

关于JAGS中数组乘法的问题 - Question about array multiplication in JAGS

我正在处理按种族分层的人口估计,我想整合来自三个不同数据源(人口普查、PEP 和 ACS)的按种族分层的人口。 我开发了一个 model 来使用来自所有这三个来源的信息并估计真实人口,其定义为县 c 时间 t 和种族 r 的 gamma.ctr(1 = 白人,2 代表非白人)。 问题是 PEP 数据 ...

JAGS 贝叶斯 MCMC 但出现以下情况:解析 model 文件时出错:第 5 行“=”附近出现语法错误 - JAGS bayesian MCMC but came into this: Error parsing model file: syntax error on line 5 near "="

当我运行我的 jags model 时,我收到此错误消息:模块 glm 加载错误在 jags.model(model.file, data = data, inits = init.values, n.chains = n.chains, : 解析 model 文件时出错:第 5 行“=”附近的语法 ...

将 JAGS 加载到集群 - Load JAGS to cluster

我想在我正在使用的集群上安装 jagsUI。 但是,这需要我加载已安装在计算机上的 JAGS4.3.0 模块。 这是我在安装 jagsUI 时遇到的错误: 我已经在我的终端上检查了 jags 是否已经安装。 当我在连接到集群的终端中执行模块时,没有显示 jags 的模块文件。 我是否将 JAGS ...

运行时错误:索引超出范围获取 theta 的子集 - RUNTIME ERROR: Index out of range taking subset of theta

我有一个看起来像这样的数据框: 我正在使用 jags 执行 MCMC 算法,但我总是得到错误: 这是源文件: 这是我从原始源文件中使用的代码: 回溯错误来自原始源文件中的行 有人可以帮我弄清楚为什么会出现错误: 另外,我在数据文件中将 s 变量更改为数字,但我没有在这里显示。 将其保留为字符也会产生 ...

如何使 function 中的变量等于先前在 jags 中的试验中该变量的总和 - How to make a variable in the function equal to the sum of that variable in previous trials in jags

在我的 model 中,我有 10 个选项(从 1 到 10)供每个主题和每个试验选择( expectancy )。 我根据下图中的规则计算了每个选项的值,因此每个选项的值都根据每次试验中的shock和v之间的差异进行更新(乘以alpha )。 然后,我使用 softmax 规则将每个选项的v转换为 ...

2021-02-23 19:51:59   1   72    r / jags / r2jags  
将 R2jags 对象转换为 Stanreg (rstanarm) 对象 - Converting a R2jags object into a Stanreg (rstanarm) object

我使用R2jags制作了一个模型。 我喜欢jags语法,但我发现R2jags生成的输出不容易使用。 我最近阅读了rstanarm包。 它有许多有用的功能,并且得到了tidybayes和bayesplot包的良好支持,可以轻松进行模型诊断和可视化。 但是,我不喜欢用于在rstanarm编写模型的rst ...

为什么使用 rjags 和 R2Jags 拟合的模型输出不同? - Why is the model output from a fit with rjags and R2Jags different?

我正在努力使用组级预测变量拟合多级逻辑回归模型。 我通过 R 使用 JAGS。当我使用runjags和R2Jags包拟合模型时,我得到了不同的行为。 我试图写一个可重现的例子来说明这个问题。 下面,我模拟来自二项式模型的数据,将数据索引到 8 个图和 2 个块,然后拟合多级逻辑回归以恢复下面代码中 ...

“function 中的不合格参数:”使用 JAGS 进行简单线性回归 - “non-conforming parameters in function :” in simple linear regression using JAGS

我对 JAGS 和贝叶斯统计非常陌生,并且一直在尝试遵循 Crawley 的第二版 R 书中关于贝叶斯统计的第 22 章。 我完全按照书中简单线性 model 的代码复制代码:growth = a + b *tannin,其中有 9 行两个连续变量:增长和单宁。 数据和包是这样的: ASCII 文 ...

如何在JAGS模型中处理“带有inprod函数的不合格参数” - How to deal with “Non-conforming parameters with inprod function” in JAGS model

我正在尝试使用R2jags使用相机诱捕站的栖息地协变量来模拟总体物种丰富度的方差。 但是,我不断收到错误: 我在以前的JAGS模型中使用了非常相似的函数(以查找物种丰富度),所以我不确定为什么它现在不起作用... 我已经尝试过以不同的方式将inprod函数中的协变量格式化为数据帧 ...

如何在R2jags :: jags中修复“节点与父节点不一致” - How to fix 'Node inconsistent with parents' in R2jags::jags

我正在使用R-package R2jags。 运行下面附带的代码后,R生成错误消息:“节点与父节点不一致”。 我试着解决它。 但是,错误消息仍然存在。 我使用的变量是: i)“Adop”:0-1虚拟变量。 ii)“NumInfo”:计数器变量,其范围为{0,1,2,... ...

R JAGS:尺寸不匹配 - R JAGS: Dimension mismatch

我试图在JAGS中运行模型,但出现以下错误: 我指定的型号是 然后,我指定数据和初始值。 最后,我运行模型。 你能帮助我吗? 您知道我为什么会收到此错误吗? 提前致谢。 ...

2018-11-03 18:39:12   1   206    r / jags / r2jags  

 
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