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是否可以在 SOM-Cluster 中使用维度值创建热图,而该维度值未包含在 R 中的集群本身中? - Is it possible to create a heatmap within a SOM-Cluster with the values of a dimension, which is not included in the cluster itself in R?

我在 R 中的 kohonen package 的帮助下创建了一个聚类。该聚类由 6 个不同的属性定义,并产生一个 15x15 矩阵 = 225 个不同的聚类。 现在我想创建某种图例,根据特定值(如热图)用不同的颜色填充每个集群可视化。 问题是,这个特定值不是定义集群的 6 个属性的一部分。 因此 ...

使用 SOM 聚类 - Clustering using SOM

我有一个由 6 维数据点组成的数据集。 我想为此数据生成一个自组织 map 以查看我的数据如何聚类以及我的数据集中有多少个不同的聚类。 我的数据集未标记。 我遇到的所有示例都带有标签(虹膜数据集)。 我使用了各种 python 包(minisom、sompy、susi)来实施 SOM,但我无法可视化 ...

无法使用 R 的 kohonen package 引用在 som 分析中聚集的基因 - Not able to refer back to genes clustered in som analysis using R's kohonen package

我遇到了一个问题,我正在尝试使用 R 中的 kohonen package 应用 SOM 分析。 我使用的数据集是基因表达 dataframe。 我正在使用下面给出的代码, 其中 bink 是 dataframe 具有 1198 个基因的表达值,其中基因名称在如下所示的列中, 下面给出代码的res ...

2022-01-06 16:42:10   1   17    r / som  
如何解决错误: storage.mode(x) &lt;- "double": 'list' object 中的错误不能强制输入'double' - how to solve error : Error in storage.mode(x) <- "double" : 'list' object cannot be coerced to type 'double'

您好我正在尝试运行 som 和 kmeans 分析。 但我无法解决它,因为有一个错误代码。 storage.mode(x) &lt;-“double”中的错误:“list”object 不能强制输入“double” 我怎么解决这个问题? 我想聚集成 6 个集群。 请帮我我使用这些数据。 htt ...

supersom(list(X), ...) 中的错误:缺少参数“X”,kohonen 包 som 函数中没有默认值 - Error in supersom(list(X), ...) : argument "X" is missing, with no default in kohonen package som function

我正在尝试在 kohonen 包中应用 som 函数(绘制 SOM),但出现以下错误: supersom(list(X), ...) 中的错误:缺少参数“X”,没有默认值。 我尝试应用的代码如下: ... load("somInput.rdata") ... 在上面的最后一行 ...

2020-03-19 12:14:50   1   197    r / som  
自组织地图:如何从图中识别集群? - Self-organizing map: How to identify clusters from plots?

我一直在学习神经网络,最近一直在尝试不同的聚类方法。 但与 KNN、GMM 或 DBSCAN 不同,没有一个功能(在我知道的 Matlab 中)可以为您识别集群。 所以我一直在阅读有关如何解释这些情节的文章,但我仍然感到困惑。 对于我的示例,在权重位置图中,我看到了一个集群。 对于邻居权重差异,我 ...

我如何知道一个元素在python中属于哪个自组织映射(SOM)集群? - How can I know which cluster of self-organizing map (SOM) an element belongs to in python?

我是聚类和神经网络的新手,我刚刚开始使用自组织映射 (SOM) 来执行一些聚类。 我有一个 15 维数据集,我用下一个代码创建了一个 som: 我以下一种方式绘制了 som: 我的问题是:如果我有一个新的 15 维元素,我怎么知道 som 属于哪个簇? ...

R、SOM、Kohonen 包、异常值检测 - R, SOM, Kohonen Package, Outlier Detection

我用 SOM 做了一些实验。 首先我在 Python 中使用 MiniSOM 但我没有留下深刻的印象并改用 R 中的 kohonen 包,它提供了比前一个更多的功能。 基本上,我将 SOM 应用于三个用例:(1) 使用生成的数据在 2D 中进行聚类,(2) 使用多维数据进行聚类:内置葡萄酒数据集,以 ...

2019-05-14 15:51:59   1   451    r / outliers / som  
在 Pyspark 上高效实现 SOM(自组织映射) - Efficient implementation of SOM (Self organizing map) on Pyspark

我正在努力在 Spark / Pyspark 上为具有 &gt; 100 个特征的巨大数据集实现 SOM 批处理算法的高性能版本。 我有一种感觉,我可以使用 RDD,我可以/必须自己指定并行化,或者我使用 Dataframe,它应该具有更高的性能,但我看不出如何在使用时为每个工人使用局部累积变量之类 ...

如何获取每个节点中 SOM 图中的簇数? - How to get the number of cluster on the SOM plot, in each of the node?

我想了解在获得 som 情节后我的酒连接到哪个节点。 这就是为什么首先我们需要获取带有葡萄酒名称和葡萄酒所属集群数量的 data.frame。 下一步是查看此图上的集群数量。 但我知道如何:) 现在我希望在 som 图中显示集群的数量。 是否有任何建议如何应对? 希望得到任何答案:) ...


 
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