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在python中使用lxml和xpath通过xml属性动态搜索

[英]Dynamic search through xml attributes using lxml and xpath in python

我正在努力将下一个xml数据移动到分层数据框架中。 感谢SO的帮助,我能够从xml中获取所有数据。 但是,现在,我要清理提取的数据并在输出之前对其进行整形,因为我将做数千次。

更新:这就是我想要的。 我似乎无法动态获取channelTimevalue 频道名称将随每个文件而变化。

channel = txt1[0] (对于此文件, txt1[0]="blah" )到channel = txt1[8] (对于此文件, txt1[8]="lir"

    channel      Time                    value
0     blah     2013-05-01 00:00:00    258
1     blah     2013-05-01 00:01:00    259
...
n-2   lir      2013-05-01 23:57:00    58
n-1   lir      2013-05-01 23:58:00    37
n     lir      2013-05-01 23:59:00    32

这是我的xml文件的获取和结构方式:

import requests
from lxml import etree, objectify
r = requests.get('https://api.stuff.us/place/getData?   security_key=key&period=minutes&startTime=2013-05-01T00:00&endTime=2013-05-01T23:59&sort=channel') #edited for privacy
root = etree.fromstring(r.text)
xml_new = etree.tostring(root, pretty_print=True)
print xml_new[300:900] #gives xml output to show structure
<startTime>2013-05-01 00:00:00</startTime>
<endTime>2013-05-01 23:59:00</endTime>
<summaryPeriod>minutes</summaryPeriod>
<data>
  <channel channel="97925" name="blah"> 
    <Time Time="2013-05-01 00:00:00">
      <value>258</value>
    </Time>
    <Time Time="2013-05-01 00:01:00">
      <value>259</value>
    </Time>
    <Time Time="2013-05-01 00:02:00">
      <value>258</value>
    </Time>
    <Time Time="2013-05-01 00:03:00">
      <value>257</value>
    </Time>

昨天,我在SO上问过此问题,并解决了将timevalue值放入数据帧的问题:将xml解析为pandas数据帧会引发内存错误

dTime=[]
dvalue=[]
for df in root.xpath('//channel/Time'):
    ## Iterate over attributes of Time but Time only has one attrib [@Time]
    for attrib in df.attrib:
    dTime.append(df.attrib[attrib])
    ## value is a child of time, and iterate
    subfields = df.getchildren()
    for subfield in subfields:
    dvalue.append(subfield.text)
pef=DataFrame({'Time':dTime,'values':dvalue})

pef

&ltclass 'pandas.core.frame.DataFrame'&gt
Int64Index: 12960 entries, 0 to 12959
Data columns (total 2 columns):
Time     12960  non-null values
value    12960  non-null values
dtypes: object(2) 

pef[:5]

    Time                    value
0    2013-05-01 00:00:00    258
1    2013-05-01 00:01:00    259
2    2013-05-01 00:02:00    258
3    2013-05-01 00:03:00    257
4    2013-05-01 00:04:00    257

现在,我正在分别处理每个通道的数据(结构是channel > Time > value ),以便可以将通道插入为数据集的列。

因此,我决定动态获取通道名称并搜索数据。对于此文件,有九个单独的有效通道名称,但对于所有文件(编号或名称)来说都不相同。

txt1 = root.xpath('//channel/@name') #this prints all channel names!
len(txt1)
Out[67]: 9
print txt1
['blah', 'b', 'c', 'd', 'vd', 'ef', 'fg', 'kc', 'lir']

我以为我可以动态获取数据(使用较早的解决方案,但添加@name=txt1[0] )并最终for i = 0 to len(txt1), ...以遍历所有数据。 但是我得到一个空的数据框:

dTime=[]
dchannel = txt1[0] # can hardcode, but need to be able to get all
dvalue=[]
for df in root.xpath('//channel[@name=txt1[0]]/Time'):
    #CODE NEEDED: to get dchannel to dynamically = channel[@name]
    ## Iterate over attributes of time for specific channel
    for attrib in df.attrib:
    dTime.append(df.attrib[attrib])
    ## value is a child of time, and iterate
    subfields = df.getchildren()
    for subfield in subfields:
    dvalue.append(subfield.text)
perf=DataFrame({'Channel': dchannel,'Time':dTime,'values':dvalue})

perf

Int64Index([], dtype=int64)
Empty DataFrame

如果我对所需的属性进行硬编码,例如for df in root.xpath('/*/*/*/channel[@name="blah"]/Time'):它将为一个属性打印它,但我无法获取它可以参考txt1[]来工作。

我尝试参考{0}..., txt1[]但是随后它为dchannel属性吐出一个元组(因为它获取了txt1的全部,而不是获取时间节点的父级的txt1属性名。

我查看了XPath文档,并阅读了lxml教程,但无法弄清楚为什么我的动态搜索不起作用。 我需要退回到.findall()吗? 如何使用此动态搜索获取txt1每个值的数据?

可能有一种更Python化的方法来实现此目的,例如设置一个函数,该函数获取父级的属性[@name] ,子级的属性[@Time]以及孙子value的文本,但是我有还不知道该怎么做。

好的,我解决了这个问题-但解决方案仍然很难看。

我很高兴弄清楚它能得到我想要的输出。 如果有人有更清洁的方法,我希望看到它。 谢谢。

dTime=[]
dchannel = []
dvalue=[]
for df in root.xpath('//channel/Time'):
    dchannel.append(df.getparent().attrib['name'])
    ## Iterate over attributes of time for specific channel
    for attrib in df.attrib:
    dTime.append(df.attrib[attrib])
    ## value is a child of time, and iterate
    subfields = df.getchildren()
    for subfield in subfields:
    dvalue.append(subfield.text)
perf=DataFrame({'Channel': dchannel,'Time':dTime,'values':dvalue})

perf[:2]
   Channel     Time                    value
0    blah        2013-05-01 00:00:00    258
1    blah        2013-05-01 00:01:00    259
2    blah        2013-05-01 00:02:00    258

perf[12957:12960]
   Channel     Time                    value
12957   lir      2013-05-01 00:00:00    67
12958   lir      2013-05-01 00:01:00    67
12959   lir      2013-05-01 00:02:00    66

好极了

暂无
暂无

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